More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3439 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3439  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
242 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4282  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
242 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4084  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
242 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1959  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  98.35 
 
 
242 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131421  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3156  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  90.08 
 
 
242 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.805014  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3270  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  90.08 
 
 
242 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2389  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  90.08 
 
 
242 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1124  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  90.08 
 
 
242 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1404  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  90.08 
 
 
242 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.595222  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2096  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  90 
 
 
240 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1485  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  90 
 
 
240 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2355  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  89.26 
 
 
242 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  71.67 
 
 
240 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  71.67 
 
 
240 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  71.67 
 
 
240 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  71.67 
 
 
240 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  71.67 
 
 
240 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.83 
 
 
240 aa  355  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.42 
 
 
240 aa  351  5e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.58 
 
 
240 aa  351  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.83 
 
 
240 aa  350  8e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.58 
 
 
240 aa  350  8e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.83 
 
 
240 aa  350  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.83 
 
 
240 aa  349  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  70.83 
 
 
240 aa  349  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.83 
 
 
240 aa  349  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  70.83 
 
 
240 aa  349  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.83 
 
 
240 aa  349  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.83 
 
 
240 aa  349  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.83 
 
 
240 aa  348  4e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.83 
 
 
240 aa  348  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.83 
 
 
240 aa  348  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3697  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.71 
 
 
242 aa  348  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270266  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.42 
 
 
240 aa  347  7e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.17 
 
 
240 aa  347  7e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.17 
 
 
240 aa  345  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1154  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  68.75 
 
 
246 aa  342  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1708  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.29 
 
 
242 aa  335  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.871153  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  61.41 
 
 
243 aa  300  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  60.17 
 
 
244 aa  299  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.83 
 
 
244 aa  291  5e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  59.41 
 
 
240 aa  290  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  59.41 
 
 
249 aa  290  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  59.32 
 
 
243 aa  288  6e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  58.9 
 
 
243 aa  286  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  58.9 
 
 
243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  59.41 
 
 
240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  55.6 
 
 
263 aa  284  9e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.92 
 
 
244 aa  284  9e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  57.74 
 
 
243 aa  284  9e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  58.58 
 
 
239 aa  284  9e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  54.81 
 
 
240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  57.32 
 
 
246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  56.49 
 
 
240 aa  281  5.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  57.68 
 
 
244 aa  281  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  56.69 
 
 
262 aa  281  9e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  59.59 
 
 
263 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  58.58 
 
 
240 aa  279  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  56.49 
 
 
247 aa  278  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.96 
 
 
244 aa  278  7e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.85 
 
 
242 aa  278  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  53.11 
 
 
242 aa  277  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  59 
 
 
243 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  56.07 
 
 
244 aa  276  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  57.74 
 
 
243 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.07 
 
 
242 aa  275  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  56.49 
 
 
243 aa  275  6e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.36 
 
 
244 aa  275  6e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.07 
 
 
242 aa  275  6e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  54.81 
 
 
240 aa  274  8e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  55.47 
 
 
258 aa  273  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  57.03 
 
 
267 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  58 
 
 
254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  54.81 
 
 
254 aa  272  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  54.81 
 
 
254 aa  272  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  54.81 
 
 
242 aa  272  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  56.49 
 
 
243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  56.49 
 
 
243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  53.56 
 
 
241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  54.88 
 
 
259 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.58 
 
 
278 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  55.65 
 
 
255 aa  271  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  55.23 
 
 
242 aa  271  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  56.78 
 
 
248 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  53.94 
 
 
244 aa  270  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  56.07 
 
 
240 aa  269  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  56.07 
 
 
240 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.23 
 
 
240 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  53.2 
 
 
256 aa  269  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  52.28 
 
 
242 aa  269  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  52.72 
 
 
242 aa  270  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  54.43 
 
 
240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  53.97 
 
 
242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  53.56 
 
 
242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4634  ABC transporter related  55.69 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  56.36 
 
 
248 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  54.77 
 
 
244 aa  268  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  53.56 
 
 
240 aa  268  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.58 
 
 
244 aa  268  8e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  56.07 
 
 
242 aa  268  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>