More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0164 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  509  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  85.71 
 
 		 252 aa  444  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  74.8 
 
 		 252 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  72.73 
 
 		 255 aa  358  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  74.17 
 
 		 261 aa  357  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  71.78 
 
 		 246 aa  354  7.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  66.39 
 
 		 249 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  65.98 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  65.98 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  66.53 
 
 		 241 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  65.27 
 
 		 241 aa  314  7e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  64.58 
 
 		 244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  64.85 
 
 		 241 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.98 
 
 		 244 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  63.22 
 
 		 242 aa  308  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  62.2 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  62.66 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  62.92 
 
 		 245 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  61.41 
 
 		 243 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  61.25 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  61 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  61.32 
 
 		 245 aa  295  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  61.32 
 
 		 245 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  60.58 
 
 		 243 aa  293  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  60.08 
 
 		 245 aa  291  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  60.49 
 
 		 245 aa  291  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  60.5 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  57.5 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  58.51 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  59.34 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.34 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  58.09 
 
 		 247 aa  282  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  57.68 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.2 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  58.23 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  59.83 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  56.8 
 
 		 265 aa  278  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  54.96 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  54.96 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  57.02 
 
 		 242 aa  274  8e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  58.51 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  56.61 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  56.61 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  58.09 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  59.92 
 
 		 245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  57.14 
 
 		 244 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  55.83 
 
 		 246 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  56.67 
 
 		 242 aa  271  9e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  56.96 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  56.85 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  53.06 
 
 		 252 aa  268  5e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.72 
 
 		 243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  56.72 
 
 		 242 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2506  ABC transporter  53.08 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0247071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  54.17 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.83 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  54.96 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  56.3 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  54.58 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  55.19 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  58.95 
 
 		 506 aa  265  5e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  56.54 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2778  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 		 263 aa  264  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217633  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  54.58 
 
 		 248 aa  264  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  54.2 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  54.58 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  52.48 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  54.2 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.82 
 
 		 267 aa  262  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  55 
 
 		 248 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  54.17 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  54.77 
 
 		 265 aa  261  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  51.92 
 
 		 289 aa  261  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  54.8 
 
 		 249 aa  261  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 273 aa  261  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  54.36 
 
 		 239 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  55 
 
 		 252 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  56.68 
 
 		 266 aa  261  8e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  52.12 
 
 		 289 aa  260  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  55.87 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  56.68 
 
 		 266 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5811  ABC transporter related  54.33 
 
 		 268 aa  259  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306389  normal  0.349168 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  54.62 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.12 
 
 		 278 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  54.94 
 
 		 262 aa  260  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  56.1 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  55.04 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4842  ABC transporter related  53.23 
 
 		 265 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463147  normal  0.18459 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  53.39 
 
 		 288 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.11 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4287  ABC transporter related  53.23 
 
 		 265 aa  258  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.39 
 
 		 247 aa  259  4e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  52.97 
 
 		 239 aa  258  7e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  56.85 
 
 		 251 aa  258  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.38 
 
 		 257 aa  258  7e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  53.56 
 
 		 247 aa  258  7e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  52.16 
 
 		 264 aa  258  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  54.81 
 
 		 260 aa  258  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>