More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1030 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  488  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  63.14 
 
 		 246 aa  305  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  65.27 
 
 		 243 aa  304  9.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  64.14 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  63.56 
 
 		 262 aa  298  7e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  63.09 
 
 		 243 aa  292  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  59 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  61.86 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  61.8 
 
 		 244 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  60.52 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  60.09 
 
 		 245 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  61.86 
 
 		 242 aa  281  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  61.44 
 
 		 257 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.09 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  57.94 
 
 		 255 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  56.78 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  58.12 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  59.32 
 
 		 242 aa  278  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  58.87 
 
 		 249 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  58.87 
 
 		 249 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  58.87 
 
 		 249 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  60.43 
 
 		 245 aa  275  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  59.05 
 
 		 241 aa  274  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  60 
 
 		 245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  55.46 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  59.24 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  58.05 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  59.57 
 
 		 245 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  57.2 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  59.15 
 
 		 245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  55.83 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  54.39 
 
 		 242 aa  268  5.9999999999999995e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  56.36 
 
 		 247 aa  268  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  53.94 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  56.72 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  55.42 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  55.83 
 
 		 247 aa  265  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  54.66 
 
 		 248 aa  265  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 		 248 aa  265  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  55.83 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  56.17 
 
 		 240 aa  264  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  56.36 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  55.23 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  53.39 
 
 		 252 aa  262  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  56.9 
 
 		 241 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  52.97 
 
 		 265 aa  261  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2511  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.48 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000409098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  53.16 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  52.94 
 
 		 244 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  52.97 
 
 		 252 aa  258  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  56.41 
 
 		 246 aa  258  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  56.03 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  51.28 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.32 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.32 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  54.51 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.32 
 
 		 244 aa  255  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.74 
 
 		 244 aa  255  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  53.85 
 
 		 249 aa  255  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  54.66 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  53.65 
 
 		 241 aa  254  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.32 
 
 		 244 aa  254  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.32 
 
 		 244 aa  254  9e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  54.01 
 
 		 240 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.32 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0476  ABC transporter related  56.28 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.61284 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.32 
 
 		 244 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  51.46 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  54.42 
 
 		 506 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0968  ABC transporter related  50.81 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  51.9 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  55.56 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  53.56 
 
 		 247 aa  253  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.9 
 
 		 244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  51.27 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.14 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  52.99 
 
 		 244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  51.93 
 
 		 242 aa  251  5.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  53.62 
 
 		 241 aa  251  6e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  54.24 
 
 		 240 aa  251  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  53.62 
 
 		 241 aa  251  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.56 
 
 		 240 aa  251  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  53.42 
 
 		 243 aa  251  7e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  52.32 
 
 		 241 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  52.97 
 
 		 243 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  51.27 
 
 		 253 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  55.04 
 
 		 243 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  53.97 
 
 		 263 aa  250  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.14 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.14 
 
 		 240 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  53.22 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.14 
 
 		 240 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.14 
 
 		 240 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  52.99 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.14 
 
 		 240 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  48.95 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.14 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  53.22 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50.64 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4091  ABC transporter related  50.21 
 
 		 247 aa  250  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.231596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>