More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1582 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 240 aa  487  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  98.33 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  92.08 
 
 		 240 aa  454  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  91.25 
 
 		 240 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  91.25 
 
 		 240 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  91.25 
 
 		 240 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  91.25 
 
 		 240 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  91.25 
 
 		 240 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  91.25 
 
 		 240 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  90.83 
 
 		 240 aa  448  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  90.83 
 
 		 240 aa  448  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  90.83 
 
 		 240 aa  448  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  90.83 
 
 		 240 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  90.42 
 
 		 240 aa  445  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  90.83 
 
 		 240 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  89.17 
 
 		 240 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  89.17 
 
 		 240 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  89.17 
 
 		 240 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  89.17 
 
 		 240 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  89.17 
 
 		 240 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  86.25 
 
 		 240 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  85.83 
 
 		 240 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  85.42 
 
 		 240 aa  420  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1959  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.83 
 
 		 242 aa  348  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3439  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.83 
 
 		 242 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4282  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.83 
 
 		 242 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4084  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.83 
 
 		 242 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3697  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.46 
 
 		 242 aa  340  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270266  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2389  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70 
 
 		 242 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3156  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70 
 
 		 242 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.805014  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1124  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70 
 
 		 242 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1404  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70 
 
 		 242 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.595222  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3270  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70 
 
 		 242 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2096  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70 
 
 		 240 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1485  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70 
 
 		 240 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2355  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70 
 
 		 242 aa  338  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1154  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  71.13 
 
 		 246 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1708  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  66.25 
 
 		 242 aa  320  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.871153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  64.02 
 
 		 244 aa  315  5e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  64.44 
 
 		 249 aa  314  9e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  62.34 
 
 		 239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  61.51 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  61.92 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  60.67 
 
 		 244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  62.08 
 
 		 244 aa  299  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  61.44 
 
 		 244 aa  298  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.83 
 
 		 242 aa  298  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.83 
 
 		 242 aa  297  9e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  59.41 
 
 		 243 aa  295  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  59.83 
 
 		 242 aa  295  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  60.42 
 
 		 243 aa  295  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  58.75 
 
 		 243 aa  295  6e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  61.02 
 
 		 243 aa  294  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  60.59 
 
 		 243 aa  293  1e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  60.67 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  58.58 
 
 		 245 aa  292  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  60.59 
 
 		 243 aa  292  4e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59.66 
 
 		 246 aa  292  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  60.25 
 
 		 255 aa  291  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  59 
 
 		 240 aa  291  8e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  59.2 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  57.74 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  56.9 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  57.74 
 
 		 242 aa  288  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  57.96 
 
 		 263 aa  288  7e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  57.5 
 
 		 243 aa  287  9e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  58.16 
 
 		 243 aa  286  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1091  ABC transporter related  63.6 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.589551  normal  0.0194834 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  55.65 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  57.74 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  57.32 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 240 aa  285  5e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  57.74 
 
 		 242 aa  285  5e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  57.32 
 
 		 242 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  54.81 
 
 		 242 aa  284  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  56.47 
 
 		 262 aa  284  8e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  57.32 
 
 		 240 aa  284  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  55.23 
 
 		 240 aa  284  9e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.32 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  56.9 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  57.56 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  57.32 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  57.74 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  56.49 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  57.32 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  56.9 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  56.9 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  57.45 
 
 		 246 aa  281  8.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  57.74 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  54.81 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  58.58 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  56.07 
 
 		 245 aa  280  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  55.14 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.65 
 
 		 240 aa  279  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  55.65 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  56.49 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  55.88 
 
 		 261 aa  278  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>