More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5268 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  95.85 
 
 		 241 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  82.92 
 
 		 241 aa  400  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  72.92 
 
 		 246 aa  359  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  70.46 
 
 		 255 aa  342  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  68.62 
 
 		 244 aa  338  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  68.2 
 
 		 243 aa  338  7e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  70.04 
 
 		 261 aa  336  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.2 
 
 		 244 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  67.36 
 
 		 245 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  65.69 
 
 		 242 aa  332  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  67.77 
 
 		 245 aa  331  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  67.77 
 
 		 245 aa  331  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  67.77 
 
 		 245 aa  331  7.000000000000001e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  66.12 
 
 		 248 aa  330  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  66.12 
 
 		 245 aa  327  8e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  65.69 
 
 		 244 aa  327  8e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  65.69 
 
 		 249 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  65.27 
 
 		 249 aa  322  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  65.27 
 
 		 249 aa  322  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  66.53 
 
 		 252 aa  318  7e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  64.44 
 
 		 252 aa  314  7e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  64.44 
 
 		 252 aa  309  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  63.87 
 
 		 243 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  61.92 
 
 		 242 aa  302  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  61.76 
 
 		 243 aa  301  9e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  60.25 
 
 		 243 aa  301  9e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  61.76 
 
 		 247 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  61.76 
 
 		 248 aa  298  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.76 
 
 		 248 aa  298  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  61.34 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  60.5 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  60.08 
 
 		 247 aa  291  9e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  60.25 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  58.82 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  57.63 
 
 		 240 aa  288  7e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  58.23 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  60.87 
 
 		 506 aa  282  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  57.32 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58.82 
 
 		 246 aa  281  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  56.54 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  60.5 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.54 
 
 		 244 aa  278  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  56.96 
 
 		 244 aa  278  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  56.72 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.7 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.56 
 
 		 244 aa  276  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  56.12 
 
 		 262 aa  275  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  58.23 
 
 		 246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  55.27 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  56.07 
 
 		 248 aa  272  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  58.05 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  56.54 
 
 		 260 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  55.93 
 
 		 252 aa  271  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  54.85 
 
 		 265 aa  270  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  54.85 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  58.3 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  56.3 
 
 		 242 aa  270  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  57.45 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  52.54 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  57.87 
 
 		 262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.78 
 
 		 278 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  55.7 
 
 		 249 aa  269  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  56.07 
 
 		 242 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  55.7 
 
 		 242 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  53.44 
 
 		 275 aa  267  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  54.43 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  56.3 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  54.43 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  58.05 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  54.2 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  53.59 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  55.27 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  53.81 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  57.81 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  53.81 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  54.24 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  53.81 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  56.36 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  57.38 
 
 		 256 aa  265  5e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7639  ABC transporter related protein  54.85 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5173  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  54.17 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  56.3 
 
 		 242 aa  263  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  55.51 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.78 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  54.01 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.2 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3745  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  53.28 
 
 		 266 aa  262  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  55.04 
 
 		 242 aa  262  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3476  ABC transporter related  53.28 
 
 		 266 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  56.9 
 
 		 239 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  54.62 
 
 		 242 aa  261  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  52.32 
 
 		 363 aa  261  6e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  52.32 
 
 		 363 aa  261  6e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  54.24 
 
 		 251 aa  261  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.59 
 
 		 240 aa  261  8.999999999999999e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  54.66 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  55.51 
 
 		 250 aa  260  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  54.24 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>