More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3745 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3745  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 266 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3476  ABC transporter related  99.25 
 
 		 266 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5811  ABC transporter related  72.05 
 
 		 268 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306389  normal  0.349168 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  58.1 
 
 		 256 aa  295  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  57.6 
 
 		 264 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2649  ABC transporter related  55 
 
 		 260 aa  288  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1259  ABC transporter related  57.09 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  54.84 
 
 		 240 aa  284  9e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  57.14 
 
 		 260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  55.91 
 
 		 263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5919  ABC transporter related  55.51 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  55.91 
 
 		 263 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  55.38 
 
 		 251 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  54 
 
 		 275 aa  282  5.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6912  ABC transporter related  55.51 
 
 		 258 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  53.75 
 
 		 257 aa  281  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  54.44 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  53.23 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  57.92 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 		 257 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  56.18 
 
 		 258 aa  279  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  54.44 
 
 		 254 aa  279  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  56.47 
 
 		 259 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  55.65 
 
 		 260 aa  279  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  54.44 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  53.36 
 
 		 257 aa  278  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  51.98 
 
 		 268 aa  278  7e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  54.69 
 
 		 256 aa  278  9e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  52.92 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  54 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5070  ABC transporter related  57.83 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  54 
 
 		 265 aa  275  4e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  54.3 
 
 		 256 aa  275  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.92 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  53.2 
 
 		 265 aa  273  3e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  52.99 
 
 		 255 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  54.62 
 
 		 271 aa  272  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1231  ABC transporter related  55.92 
 
 		 252 aa  271  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.903047  normal  0.0835348 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  53.23 
 
 		 260 aa  271  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  53.82 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  54.84 
 
 		 242 aa  271  9e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  54.72 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  50.4 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1455  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.78 
 
 		 256 aa  268  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0011921  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4911  ABC transporter  52.14 
 
 		 257 aa  268  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  53.6 
 
 		 261 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2343  ABC transporter related  54.25 
 
 		 245 aa  268  5e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185697  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  51.21 
 
 		 252 aa  268  7e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0338  ABC transporter related  54.47 
 
 		 285 aa  268  8e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  51.21 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  54 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0535  ABC transporter related  55.14 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5577  ABC transporter-related protein  54.92 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  54.03 
 
 		 242 aa  265  5e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  53.01 
 
 		 243 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5592  ABC transporter related  55.69 
 
 		 266 aa  265  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  52.82 
 
 		 246 aa  265  8e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.75 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0176  ABC transporter related  54.3 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  53.66 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  52.82 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  52.65 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  54.55 
 
 		 259 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0301  ABC transporter related  52.53 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal  0.0971272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0306  ABC transporter related  52.53 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0328197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  53.79 
 
 		 267 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  53.33 
 
 		 263 aa  262  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1128  ABC transporter related protein  54.8 
 
 		 266 aa  262  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  54.22 
 
 		 243 aa  262  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  53.28 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2781  ABC transporter related  54.47 
 
 		 256 aa  262  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2883  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  54.03 
 
 		 257 aa  262  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0283  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.14 
 
 		 257 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  hitchhiker  0.000143941 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  48.39 
 
 		 240 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  52.42 
 
 		 241 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003973  arginine/ornithine ABC transporter ATP-binding protein AotP  54.98 
 
 		 256 aa  261  6.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  52.02 
 
 		 241 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  52.02 
 
 		 241 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4927  ABC transporter related  52.14 
 
 		 257 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000746315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0371  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  53.04 
 
 		 265 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  51.97 
 
 		 249 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0791  ABC transporter related protein  53.01 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142657  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2015  ABC transporter related  53.04 
 
 		 265 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  52 
 
 		 250 aa  260  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  260  1e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.84 
 
 		 250 aa  260  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  50 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1849  ABC transporter related  51.37 
 
 		 251 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  48.19 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0870  ABC transporter related  52.63 
 
 		 269 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  53.25 
 
 		 244 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6594  ABC transporter related  56.3 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147367 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.81 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  53.2 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  51.81 
 
 		 243 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2653  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.73 
 
 		 267 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5748  ABC transporter related  56.3 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6112  ABC transporter related  56.3 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>