More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2653 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2653  polar amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 
267 aa  540  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1325  polar amino acid ABC transporter ATPase  85.17 
 
 
265 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  56.1 
 
 
263 aa  288  8e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  58.17 
 
 
256 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  56.63 
 
 
299 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.63 
 
 
300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  56.64 
 
 
262 aa  281  8.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  55.68 
 
 
263 aa  279  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  59.18 
 
 
243 aa  275  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  56.75 
 
 
261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  55.82 
 
 
263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  55.64 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  56.4 
 
 
254 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6448  ABC transporter related  52.55 
 
 
263 aa  272  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0465386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  56.45 
 
 
267 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  54.55 
 
 
244 aa  271  8.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5964  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.98 
 
 
263 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  54.44 
 
 
258 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.33 
 
 
250 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.33 
 
 
250 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  55.65 
 
 
252 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.4 
 
 
250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  53.91 
 
 
276 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.94 
 
 
250 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  53.66 
 
 
254 aa  269  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  55.65 
 
 
263 aa  268  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  52.14 
 
 
256 aa  268  7e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.94 
 
 
250 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.68 
 
 
254 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2698  ABC transporter related  53.78 
 
 
264 aa  266  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.94 
 
 
250 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2883  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  54.07 
 
 
257 aa  266  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410522  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  52.31 
 
 
262 aa  266  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  54.37 
 
 
567 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  53.58 
 
 
289 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  54.2 
 
 
289 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.37 
 
 
567 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.02 
 
 
252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  54.62 
 
 
258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  54.2 
 
 
288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  53.54 
 
 
254 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6087  ABC transporter related  56.35 
 
 
280 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 
240 aa  265  7e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  55.69 
 
 
267 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  52.85 
 
 
240 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  53.75 
 
 
259 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.18 
 
 
250 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.62 
 
 
252 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  54.88 
 
 
255 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  53.23 
 
 
250 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.62 
 
 
252 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 
240 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  55.78 
 
 
256 aa  263  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  50.99 
 
 
263 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  50.99 
 
 
263 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1260  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  56.2 
 
 
252 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.0306795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  53.63 
 
 
250 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  55.65 
 
 
243 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3476  ABC transporter related  53.52 
 
 
266 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  54.37 
 
 
279 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  54.18 
 
 
250 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 
244 aa  262  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.18 
 
 
250 aa  263  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.18 
 
 
250 aa  263  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  56.85 
 
 
243 aa  262  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.18 
 
 
250 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4634  ABC transporter related  50.8 
 
 
263 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  55.24 
 
 
243 aa  262  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  54.47 
 
 
256 aa  262  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  51.35 
 
 
264 aa  262  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.06 
 
 
253 aa  261  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 
244 aa  261  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.06 
 
 
253 aa  261  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  54.39 
 
 
244 aa  261  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.78 
 
 
250 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.18 
 
 
250 aa  261  8.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  53.44 
 
 
253 aa  261  8.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 
244 aa  260  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 
244 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  55.24 
 
 
255 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  53.6 
 
 
257 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  53.63 
 
 
256 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.76 
 
 
254 aa  260  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 
244 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  53.44 
 
 
251 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  53.15 
 
 
254 aa  260  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 
244 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.69 
 
 
247 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.69 
 
 
252 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.99 
 
 
250 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 
244 aa  260  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  54.47 
 
 
273 aa  260  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 
240 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 
240 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 
240 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  51.22 
 
 
240 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  51.22 
 
 
240 aa  259  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3745  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  52.73 
 
 
266 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  50.4 
 
 
240 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  55.19 
 
 
243 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>