More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1445 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  100 
 
 
249 aa  507  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  59.17 
 
 
240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  60.83 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 
242 aa  298  5e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  60.42 
 
 
247 aa  297  9e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  57.92 
 
 
242 aa  296  2e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  57.08 
 
 
240 aa  296  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  59.58 
 
 
240 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  57.5 
 
 
242 aa  296  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  59.58 
 
 
242 aa  295  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  56.63 
 
 
244 aa  294  7e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  58.68 
 
 
244 aa  294  8e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  57.08 
 
 
240 aa  292  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1231  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 
242 aa  292  4e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  58.33 
 
 
244 aa  291  8e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  57.08 
 
 
241 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  56.73 
 
 
257 aa  289  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 
240 aa  289  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  56.02 
 
 
255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  56.67 
 
 
241 aa  288  6e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  56.67 
 
 
241 aa  288  6e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  55.83 
 
 
240 aa  288  7e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.92 
 
 
240 aa  288  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 
241 aa  288  8e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  56.67 
 
 
241 aa  287  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 
240 aa  286  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 
240 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  57.32 
 
 
247 aa  286  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 
240 aa  286  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  55.42 
 
 
241 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 
240 aa  286  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 
240 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  56.25 
 
 
241 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  55.42 
 
 
241 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 
240 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 
240 aa  285  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 
240 aa  285  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  55.14 
 
 
247 aa  285  4e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  55.42 
 
 
241 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.17 
 
 
242 aa  285  5e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  55 
 
 
241 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  56.07 
 
 
249 aa  284  8e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  53.53 
 
 
241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  56.15 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  55.42 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  56.67 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 
242 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.233716  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  54.88 
 
 
257 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0981  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.17 
 
 
242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  55.74 
 
 
244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  56.25 
 
 
241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  53.33 
 
 
242 aa  281  5.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  55.74 
 
 
244 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.6 
 
 
249 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  54.85 
 
 
246 aa  281  7.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  56.67 
 
 
244 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.92 
 
 
246 aa  281  8.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  56.07 
 
 
243 aa  281  9e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 
244 aa  280  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  54.58 
 
 
242 aa  280  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  58.33 
 
 
239 aa  280  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 
242 aa  280  2e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.75 
 
 
242 aa  279  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.250049  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  55.88 
 
 
246 aa  279  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.42 
 
 
244 aa  279  3e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  56.67 
 
 
240 aa  278  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  54.77 
 
 
246 aa  279  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.09 
 
 
244 aa  278  4e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  53.75 
 
 
243 aa  276  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  55.42 
 
 
243 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  53.33 
 
 
243 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  54.92 
 
 
244 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  55.83 
 
 
240 aa  275  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  53.09 
 
 
244 aa  275  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  55.42 
 
 
240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  53.33 
 
 
243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  53.36 
 
 
247 aa  272  3e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  53.53 
 
 
248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2280  ABC transporter related protein  50.73 
 
 
274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113339  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  52.61 
 
 
257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  53.53 
 
 
242 aa  271  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  53.53 
 
 
242 aa  271  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  52.5 
 
 
240 aa  271  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  52.92 
 
 
240 aa  271  8.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  54.29 
 
 
249 aa  271  9e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.17 
 
 
246 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  55.83 
 
 
243 aa  270  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  54.73 
 
 
252 aa  270  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.09 
 
 
258 aa  270  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  56 
 
 
243 aa  270  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5022  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.51 
 
 
244 aa  269  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.670825  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5811  ABC transporter related  53.01 
 
 
268 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306389  normal  0.349168 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  53.75 
 
 
240 aa  270  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  52.05 
 
 
247 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  55.6 
 
 
241 aa  269  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  54.1 
 
 
263 aa  269  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.91 
 
 
244 aa  268  4e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>