More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1231 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1231  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
242 aa  490  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  78.93 
 
 
242 aa  387  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  74.79 
 
 
242 aa  375  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0981  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.79 
 
 
242 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  75.21 
 
 
242 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.233716  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.79 
 
 
242 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.250049  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.14 
 
 
242 aa  366  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  73.97 
 
 
242 aa  363  2e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  62.4 
 
 
242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  62.66 
 
 
242 aa  311  5.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  60.58 
 
 
242 aa  311  6.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  58.33 
 
 
242 aa  307  9e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  61.25 
 
 
240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 
240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  62.08 
 
 
240 aa  305  6e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
240 aa  302  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  58.75 
 
 
247 aa  301  6.000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  57.92 
 
 
247 aa  298  6e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  58.75 
 
 
240 aa  297  9e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  59.58 
 
 
241 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  59.58 
 
 
241 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  58.51 
 
 
241 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  57.68 
 
 
241 aa  295  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.67 
 
 
244 aa  294  7e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  57.74 
 
 
257 aa  294  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.17 
 
 
244 aa  293  2e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  58.75 
 
 
241 aa  292  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  57.02 
 
 
363 aa  292  3e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  57.02 
 
 
363 aa  292  3e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  56.25 
 
 
249 aa  292  3e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.02 
 
 
244 aa  292  4e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  291  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  291  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  291  6e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  56.67 
 
 
241 aa  291  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  56.49 
 
 
257 aa  291  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  56.25 
 
 
240 aa  291  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 
247 aa  291  7e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  54.39 
 
 
249 aa  291  8e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  56.67 
 
 
246 aa  291  9e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  57.92 
 
 
239 aa  291  9e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.75 
 
 
244 aa  290  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 
241 aa  290  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  58.33 
 
 
241 aa  290  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  57.5 
 
 
240 aa  289  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  57.5 
 
 
241 aa  289  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  288  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  288  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  58.33 
 
 
240 aa  288  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  288  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  288  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.42 
 
 
240 aa  288  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  55.23 
 
 
363 aa  288  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  57.08 
 
 
241 aa  287  9e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2280  ABC transporter related protein  51.82 
 
 
274 aa  287  9e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  287  9e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.77 
 
 
246 aa  287  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  287  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  54.81 
 
 
363 aa  287  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 
244 aa  287  1e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 
240 aa  286  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 
240 aa  286  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.58 
 
 
246 aa  286  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  56.07 
 
 
360 aa  286  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  52.92 
 
 
243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  51.25 
 
 
240 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  56.07 
 
 
244 aa  284  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  56.67 
 
 
248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  56.67 
 
 
248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  55.83 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  56.25 
 
 
252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55 
 
 
246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  53.94 
 
 
241 aa  281  6.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  59.65 
 
 
248 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  56.67 
 
 
240 aa  280  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  55.42 
 
 
255 aa  280  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  54.55 
 
 
243 aa  280  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.61 
 
 
242 aa  278  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.83 
 
 
240 aa  278  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  54.73 
 
 
243 aa  278  6e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  52.48 
 
 
244 aa  278  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  54.17 
 
 
240 aa  277  9e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  54.81 
 
 
249 aa  277  9e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  56.25 
 
 
246 aa  277  9e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  54.17 
 
 
240 aa  277  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.37 
 
 
242 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  51.25 
 
 
243 aa  277  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  52.89 
 
 
245 aa  276  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  53.56 
 
 
247 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  56.25 
 
 
249 aa  275  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  55.6 
 
 
246 aa  275  5e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  56.67 
 
 
247 aa  275  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  53.31 
 
 
246 aa  275  6e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  55.37 
 
 
243 aa  274  9e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  56.43 
 
 
253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  51.24 
 
 
242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  55.42 
 
 
248 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  52.07 
 
 
245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  54.32 
 
 
243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>