More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0494 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
242 aa  490  9.999999999999999e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  85.54 
 
 
242 aa  429  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  74.38 
 
 
242 aa  374  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1231  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.79 
 
 
242 aa  375  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.14 
 
 
242 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.233716  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0981  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.55 
 
 
242 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.31 
 
 
242 aa  362  4e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.250049  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.07 
 
 
242 aa  359  2e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  66.94 
 
 
242 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  65.15 
 
 
242 aa  328  4e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  62.92 
 
 
240 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 
240 aa  319  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  59.58 
 
 
240 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 
240 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
240 aa  305  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  58.33 
 
 
241 aa  305  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  305  6e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  305  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 
241 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
240 aa  304  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  58.33 
 
 
240 aa  304  9.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  58.33 
 
 
241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  57.5 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  59.75 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 
240 aa  302  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  61.25 
 
 
240 aa  301  5.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  60 
 
 
240 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  58.33 
 
 
244 aa  301  9e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  59.58 
 
 
247 aa  300  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  300  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  57.5 
 
 
241 aa  300  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  57.68 
 
 
244 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  58.75 
 
 
240 aa  299  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  57.5 
 
 
241 aa  299  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  56.25 
 
 
249 aa  298  5e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.25 
 
 
244 aa  298  6e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  55.79 
 
 
243 aa  296  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.5 
 
 
250 aa  296  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  56.25 
 
 
240 aa  296  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  59.17 
 
 
255 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 
244 aa  295  4e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.32 
 
 
244 aa  294  7e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  56.9 
 
 
360 aa  293  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  57.92 
 
 
247 aa  293  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  56.07 
 
 
363 aa  292  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  58.33 
 
 
239 aa  292  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  57.08 
 
 
242 aa  292  4e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  56.43 
 
 
246 aa  291  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  56.07 
 
 
363 aa  291  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 
240 aa  291  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  57.5 
 
 
240 aa  291  7e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2280  ABC transporter related protein  54.01 
 
 
274 aa  291  8e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113339  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  59.58 
 
 
246 aa  290  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  57.5 
 
 
247 aa  290  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  56.25 
 
 
246 aa  290  2e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  55.42 
 
 
240 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  56.79 
 
 
243 aa  289  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  55 
 
 
240 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  58.33 
 
 
248 aa  288  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.02 
 
 
244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  56.25 
 
 
240 aa  288  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  58.33 
 
 
252 aa  287  9e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  58.33 
 
 
248 aa  287  9e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  57.08 
 
 
247 aa  287  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  56.07 
 
 
363 aa  287  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  56.07 
 
 
363 aa  287  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  57.92 
 
 
246 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  56.43 
 
 
241 aa  286  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  54.55 
 
 
246 aa  286  2e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  55.37 
 
 
262 aa  286  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  55.97 
 
 
243 aa  286  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  54.55 
 
 
247 aa  285  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  54.81 
 
 
249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  57.08 
 
 
248 aa  285  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  55.65 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  54.55 
 
 
251 aa  285  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
244 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  54.58 
 
 
243 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  58.68 
 
 
247 aa  284  7e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  54.13 
 
 
257 aa  284  7e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  53.31 
 
 
242 aa  284  7e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  55.83 
 
 
240 aa  284  9e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  56.61 
 
 
243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.37 
 
 
242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  55.83 
 
 
241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  55.37 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  58.75 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  55.97 
 
 
248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  55.6 
 
 
262 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.79 
 
 
242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  54.77 
 
 
244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>