More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0439 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 
250 aa  508  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  68.33 
 
 
247 aa  337  9.999999999999999e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  63.93 
 
 
246 aa  322  5e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  63.52 
 
 
246 aa  319  1.9999999999999998e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  61.57 
 
 
247 aa  310  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  60.67 
 
 
240 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  59.83 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  61.85 
 
 
249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  61.51 
 
 
240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  59.83 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.51 
 
 
240 aa  302  4.0000000000000003e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  62.76 
 
 
240 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  60.73 
 
 
257 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.58 
 
 
244 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  60.67 
 
 
244 aa  298  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  60 
 
 
241 aa  298  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
242 aa  298  7e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  60.73 
 
 
257 aa  297  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.67 
 
 
244 aa  297  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  56.68 
 
 
252 aa  297  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.51 
 
 
244 aa  297  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
242 aa  296  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  60.25 
 
 
242 aa  296  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  59 
 
 
244 aa  296  2e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 
241 aa  295  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 
240 aa  296  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  59.58 
 
 
241 aa  295  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  59.58 
 
 
241 aa  295  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  60 
 
 
241 aa  295  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59 
 
 
240 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59 
 
 
240 aa  293  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59 
 
 
240 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 
240 aa  293  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59 
 
 
240 aa  294  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59 
 
 
240 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  58.02 
 
 
247 aa  294  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  59.17 
 
 
241 aa  293  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  58.16 
 
 
242 aa  294  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  58.16 
 
 
242 aa  294  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59 
 
 
240 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  59.17 
 
 
242 aa  293  2e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  58.16 
 
 
240 aa  293  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  57.26 
 
 
249 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  59 
 
 
240 aa  293  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 
240 aa  293  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.33 
 
 
244 aa  292  4e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  60.68 
 
 
240 aa  291  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  59 
 
 
240 aa  291  5e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  56.68 
 
 
255 aa  291  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 
240 aa  291  7e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.2 
 
 
244 aa  291  9e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  57.32 
 
 
242 aa  290  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  57.38 
 
 
249 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  57.92 
 
 
242 aa  290  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  58.33 
 
 
241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.41 
 
 
240 aa  288  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  57.32 
 
 
242 aa  288  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  58.33 
 
 
241 aa  288  8e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0528  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.57 
 
 
258 aa  288  8e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191469  normal  0.015863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  57.26 
 
 
248 aa  287  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  57.26 
 
 
248 aa  287  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  58.55 
 
 
240 aa  287  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  57.2 
 
 
246 aa  287  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  56.07 
 
 
247 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  55.23 
 
 
262 aa  286  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 
270 aa  286  2e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  56.49 
 
 
248 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  55.65 
 
 
246 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  56.9 
 
 
242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  56.9 
 
 
244 aa  285  5e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.07 
 
 
242 aa  285  5e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3694  ABC transporter related  58.23 
 
 
248 aa  285  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.749012  normal  0.245017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  56.49 
 
 
257 aa  285  5.999999999999999e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  57.32 
 
 
244 aa  285  5.999999999999999e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  56.5 
 
 
246 aa  285  7e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  56.38 
 
 
246 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  61.5 
 
 
243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  54.13 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  55.1 
 
 
246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  57.5 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  57.32 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  56.67 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  57.69 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  57.74 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  53.72 
 
 
260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.72 
 
 
260 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  56.9 
 
 
240 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  56.07 
 
 
258 aa  281  8.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.23 
 
 
240 aa  281  9e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  55.46 
 
 
247 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  56.49 
 
 
240 aa  280  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  56.41 
 
 
244 aa  280  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 
257 aa  280  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  54.58 
 
 
261 aa  280  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  54.96 
 
 
263 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  54.4 
 
 
256 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  57.51 
 
 
259 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>