More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0125 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  100 
 
 		 246 aa  508  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  64.05 
 
 		 242 aa  332  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  63.22 
 
 		 242 aa  332  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  60.74 
 
 		 242 aa  322  4e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  61.98 
 
 		 249 aa  321  8e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60.83 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  61.16 
 
 		 249 aa  319  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  61.83 
 
 		 244 aa  318  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  61.57 
 
 		 249 aa  318  6e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  59.34 
 
 		 242 aa  317  7.999999999999999e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  60.66 
 
 		 259 aa  317  7.999999999999999e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  62.14 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  58.92 
 
 		 242 aa  317  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  59.59 
 
 		 263 aa  317  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  56.49 
 
 		 247 aa  316  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  59.59 
 
 		 267 aa  316  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  61.73 
 
 		 248 aa  315  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  58.33 
 
 		 244 aa  315  5e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  58.68 
 
 		 260 aa  315  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  58.16 
 
 		 249 aa  314  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  59.26 
 
 		 247 aa  313  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.16 
 
 		 251 aa  313  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  58.37 
 
 		 263 aa  313  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  58.78 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  58.44 
 
 		 243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  58.78 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  60.33 
 
 		 243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  58.85 
 
 		 243 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.67 
 
 		 240 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  58.78 
 
 		 262 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  58.78 
 
 		 262 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  57.79 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  60.49 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  59.17 
 
 		 253 aa  310  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  57.85 
 
 		 266 aa  310  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  60.17 
 
 		 242 aa  310  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  58.09 
 
 		 242 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  58.2 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  59.18 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  57.96 
 
 		 258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  57.32 
 
 		 249 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  57.74 
 
 		 250 aa  308  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  58.02 
 
 		 243 aa  308  4e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  56.9 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  59.83 
 
 		 258 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  57.79 
 
 		 248 aa  308  6.999999999999999e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  56.33 
 
 		 286 aa  307  8e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  56.9 
 
 		 249 aa  307  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  58.2 
 
 		 244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  59.41 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  59.41 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  61.67 
 
 		 240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  59.09 
 
 		 270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  58.51 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  57.68 
 
 		 254 aa  305  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  58.68 
 
 		 252 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  57.85 
 
 		 253 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  58.85 
 
 		 251 aa  306  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  58.09 
 
 		 244 aa  306  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  57.55 
 
 		 257 aa  305  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.26 
 
 		 257 aa  306  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  57.85 
 
 		 247 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  58.33 
 
 		 253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  58.44 
 
 		 258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  57.74 
 
 		 249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  57.92 
 
 		 254 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  59.66 
 
 		 259 aa  305  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  56.35 
 
 		 253 aa  304  7e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  58.26 
 
 		 254 aa  304  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  56.43 
 
 		 242 aa  304  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.38 
 
 		 244 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  56.5 
 
 		 245 aa  304  9.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  58.33 
 
 		 254 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  58.33 
 
 		 254 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  58.51 
 
 		 252 aa  304  9.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  58.68 
 
 		 252 aa  304  9.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 		 252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  59.5 
 
 		 247 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  59.92 
 
 		 246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  58.37 
 
 		 252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 		 240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  57.02 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  60.16 
 
 		 246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  57.38 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  58.58 
 
 		 273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  60.33 
 
 		 250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  57.5 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  57.5 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  57.85 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  58.75 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  56.25 
 
 		 250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  57.61 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  56.79 
 
 		 258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  58.75 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  60.34 
 
 		 267 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  58.33 
 
 		 246 aa  302  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  57.55 
 
 		 256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>