More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0629 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 
244 aa  492  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  68.72 
 
 
247 aa  350  2e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  65.16 
 
 
244 aa  341  5.999999999999999e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 
240 aa  315  5e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  60.58 
 
 
240 aa  313  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1427  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.58 
 
 
254 aa  308  4e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.798316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  62.14 
 
 
244 aa  308  5e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.92 
 
 
240 aa  298  5e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  58.51 
 
 
241 aa  294  9e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  58.51 
 
 
241 aa  294  9e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 
241 aa  293  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.34 
 
 
244 aa  293  2e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  58.09 
 
 
241 aa  292  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  61.44 
 
 
240 aa  291  5e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 
240 aa  291  8e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  57.26 
 
 
240 aa  288  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  59.58 
 
 
257 aa  288  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 
240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  288  8e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  288  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  288  8e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  288  8e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  287  9e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  56.85 
 
 
240 aa  287  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  57.68 
 
 
241 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  58.09 
 
 
246 aa  287  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  59.34 
 
 
241 aa  286  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  286  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 
240 aa  286  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  56.43 
 
 
240 aa  286  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 
244 aa  285  2.9999999999999996e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  56.43 
 
 
240 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  57.68 
 
 
242 aa  285  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  57.68 
 
 
242 aa  285  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  57.81 
 
 
240 aa  285  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  58.09 
 
 
241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.43 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  57.68 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  57.68 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.97 
 
 
244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  57.26 
 
 
241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  56.85 
 
 
241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.92 
 
 
246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  58.33 
 
 
257 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.55 
 
 
255 aa  281  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 
242 aa  280  1e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  53.11 
 
 
247 aa  280  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  57.26 
 
 
241 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  56.85 
 
 
240 aa  279  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  55.19 
 
 
242 aa  279  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  55.19 
 
 
242 aa  278  6e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  54.39 
 
 
254 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1234  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.85 
 
 
240 aa  278  8e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.79 
 
 
249 aa  277  9e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  52.7 
 
 
242 aa  277  1e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  57.5 
 
 
249 aa  277  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  56.02 
 
 
252 aa  276  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 
242 aa  276  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.233716  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0981  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 
242 aa  276  3e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  55.51 
 
 
246 aa  275  4e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  56.79 
 
 
240 aa  275  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  53.94 
 
 
243 aa  275  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  55.83 
 
 
247 aa  275  5e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  55.37 
 
 
241 aa  275  5e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  52.5 
 
 
254 aa  274  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  54.1 
 
 
243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  54.77 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.11 
 
 
242 aa  271  5.000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  56.85 
 
 
242 aa  271  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.11 
 
 
242 aa  271  7e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.250049  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  52.28 
 
 
242 aa  270  1e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  53.69 
 
 
243 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  53.53 
 
 
242 aa  270  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  54.96 
 
 
248 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  54.77 
 
 
240 aa  270  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 
247 aa  270  1e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  51.25 
 
 
360 aa  270  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  53.75 
 
 
245 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  54.77 
 
 
244 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.6 
 
 
240 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.19 
 
 
240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  54.29 
 
 
254 aa  268  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  53.91 
 
 
249 aa  268  4e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.11 
 
 
242 aa  268  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  53.94 
 
 
246 aa  268  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  54.32 
 
 
244 aa  268  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  53.91 
 
 
244 aa  268  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  55.6 
 
 
258 aa  268  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  53.94 
 
 
242 aa  268  7e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  56.38 
 
 
247 aa  268  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  54.77 
 
 
246 aa  268  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  56.02 
 
 
251 aa  268  7e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 
270 aa  267  1e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.17 
 
 
258 aa  267  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  53.28 
 
 
244 aa  267  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  57.2 
 
 
259 aa  267  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  55.19 
 
 
239 aa  267  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  53.85 
 
 
253 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  51.87 
 
 
240 aa  266  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  53.94 
 
 
244 aa  266  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>