More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5811 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5811  ABC transporter related  100 
 
 
268 aa  547  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306389  normal  0.349168 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3476  ABC transporter related  72.05 
 
 
266 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3745  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  72.05 
 
 
266 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  58.69 
 
 
264 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  57.77 
 
 
268 aa  307  9e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  58.57 
 
 
256 aa  299  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  57.87 
 
 
263 aa  299  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  57.48 
 
 
263 aa  297  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6112  ABC transporter related  59.45 
 
 
263 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6594  ABC transporter related  59.45 
 
 
263 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.147367 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6912  ABC transporter related  55.92 
 
 
258 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5748  ABC transporter related  59.45 
 
 
263 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5919  ABC transporter related  55.51 
 
 
258 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5620  ABC transporter related  59.45 
 
 
263 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33769  normal  0.48153 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5837  ABC transporter related  59.45 
 
 
263 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  57.48 
 
 
260 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  58.8 
 
 
260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 
240 aa  285  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.22 
 
 
240 aa  285  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5103  ABC transporter related  58.66 
 
 
263 aa  284  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351754  hitchhiker  0.00435493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.22 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  53.82 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.22 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.22 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.22 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  55.24 
 
 
254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  55 
 
 
263 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  53.78 
 
 
255 aa  282  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1128  ABC transporter related protein  56.8 
 
 
266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.22 
 
 
240 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  53.63 
 
 
240 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.82 
 
 
240 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.82 
 
 
240 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  53.46 
 
 
267 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2781  ABC transporter related  55.24 
 
 
256 aa  280  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  55.78 
 
 
258 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  55.65 
 
 
240 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.23 
 
 
240 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  54.84 
 
 
254 aa  279  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2649  ABC transporter related  55.04 
 
 
260 aa  280  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  54.51 
 
 
256 aa  279  4e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  53.41 
 
 
265 aa  279  4e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  51.36 
 
 
275 aa  278  7e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.82 
 
 
244 aa  277  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  55.82 
 
 
251 aa  277  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  55.82 
 
 
258 aa  277  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  55.2 
 
 
241 aa  277  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.4 
 
 
244 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  54.44 
 
 
241 aa  276  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.24 
 
 
244 aa  276  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  52.61 
 
 
265 aa  276  3e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  52.42 
 
 
240 aa  276  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.99 
 
 
244 aa  276  4e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  53.39 
 
 
259 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  57.37 
 
 
246 aa  275  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1455  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.37 
 
 
256 aa  275  7e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0011921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.84 
 
 
240 aa  275  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  53.52 
 
 
256 aa  275  7e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0535  ABC transporter related  56.1 
 
 
255 aa  274  8e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1259  ABC transporter related  54.65 
 
 
260 aa  274  8e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  55.65 
 
 
240 aa  274  9e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.24 
 
 
240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.84 
 
 
240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  55.24 
 
 
240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  55.24 
 
 
240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.24 
 
 
240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.05 
 
 
242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.24 
 
 
240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.65 
 
 
278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  54.4 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.84 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.47 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.84 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  54.44 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0338  ABC transporter related  54.72 
 
 
285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615822  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1120  ABC transporter related  55.47 
 
 
259 aa  272  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.24 
 
 
240 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2883  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
257 aa  272  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410522  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  55.47 
 
 
259 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003973  arginine/ornithine ABC transporter ATP-binding protein AotP  56.57 
 
 
256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6396  ABC transporter related  59.51 
 
 
259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784056  normal  0.338935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01549  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.57 
 
 
256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2343  ABC transporter related  53.85 
 
 
245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185697  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2166  ABC transporter related  53.17 
 
 
261 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000000402922  hitchhiker  0.000000271628 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  53.39 
 
 
256 aa  271  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  50.4 
 
 
240 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  54.84 
 
 
259 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  52.82 
 
 
240 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  53.63 
 
 
240 aa  271  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  53.75 
 
 
259 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  56.35 
 
 
254 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  52.85 
 
 
263 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5070  ABC transporter related  55.95 
 
 
260 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60072  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  53.01 
 
 
249 aa  270  2e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  54.03 
 
 
240 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  54.03 
 
 
240 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.8 
 
 
241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  54.37 
 
 
249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  53.2 
 
 
257 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  53.2 
 
 
257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>