More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4927 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4927  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000746315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0301  ABC transporter related  98.05 
 
 		 257 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal  0.0971272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0283  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  97.67 
 
 		 257 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  hitchhiker  0.000143941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0306  ABC transporter related  97.67 
 
 		 257 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0328197  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  91.83 
 
 		 257 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  91.83 
 
 		 257 aa  488  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4911  ABC transporter  91.05 
 
 		 257 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  89.88 
 
 		 257 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  90.27 
 
 		 257 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  89.88 
 
 		 257 aa  480  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  66.53 
 
 		 265 aa  356  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  67.97 
 
 		 258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  66.14 
 
 		 265 aa  354  8.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  66.53 
 
 		 275 aa  353  1e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0338  ABC transporter related  65.61 
 
 		 285 aa  352  2.9999999999999997e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  67.33 
 
 		 255 aa  348  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  63.67 
 
 		 263 aa  342  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  64.68 
 
 		 254 aa  341  5.999999999999999e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  63.67 
 
 		 263 aa  341  8e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  63.89 
 
 		 254 aa  338  5e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  64.54 
 
 		 264 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  61.81 
 
 		 256 aa  334  7e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  62.4 
 
 		 268 aa  334  7.999999999999999e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6594  ABC transporter related  64.59 
 
 		 263 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147367 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6112  ABC transporter related  64.59 
 
 		 263 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5748  ABC transporter related  64.2 
 
 		 263 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5620  ABC transporter related  64.2 
 
 		 263 aa  329  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33769  normal  0.48153 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5837  ABC transporter related  64.2 
 
 		 263 aa  329  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1259  ABC transporter related  60.08 
 
 		 260 aa  328  4e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2649  ABC transporter related  59.69 
 
 		 260 aa  326  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5103  ABC transporter related  63.92 
 
 		 263 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351754  hitchhiker  0.00435493 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1455  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.94 
 
 		 256 aa  324  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0011921  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0535  ABC transporter related  62.65 
 
 		 255 aa  323  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  61.09 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2781  ABC transporter related  57.87 
 
 		 256 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2789  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  60.32 
 
 		 264 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.782335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2429  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 		 264 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2862  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 		 264 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0589  arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.92 
 
 		 264 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2851  histidine transport ATP-binding protein  59.92 
 
 		 264 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1739  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 		 264 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4530  ABC transporter related  64.84 
 
 		 259 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0252344  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2730  ABC-type histidine transport system, ATPase component  59.92 
 
 		 264 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 		 264 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2883  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  60.24 
 
 		 257 aa  317  9e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52750  arginine/ornithine transport protein AotP  64.37 
 
 		 254 aa  317  9e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6396  ABC transporter related  64.06 
 
 		 259 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784056  normal  0.338935 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003973  arginine/ornithine ABC transporter ATP-binding protein AotP  63.35 
 
 		 256 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4622  arginine/ornithine transport protein AotP  63.97 
 
 		 254 aa  316  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2913  ABC transporter related  63.56 
 
 		 254 aa  315  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.289619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4289  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  59.45 
 
 		 266 aa  315  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2452  ABC transporter related  59.22 
 
 		 259 aa  315  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0182129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1059  ABC transporter related  59.45 
 
 		 266 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1056  ABC transporter related  59.45 
 
 		 266 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0698  ABC transporter related  59.45 
 
 		 274 aa  314  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1177  ABC transporter related  59.45 
 
 		 274 aa  314  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5734  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  59.22 
 
 		 259 aa  314  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.791565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2317  ABC transporter related  59.22 
 
 		 259 aa  314  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.687012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3988  ABC transporter related  63.97 
 
 		 254 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929091 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  60.66 
 
 		 264 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01549  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.95 
 
 		 256 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1090  ABC transporter related  63.41 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455467  normal  0.0958562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3772  ABC transporter related  63.56 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446959  hitchhiker  0.00629002 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5919  ABC transporter related  61.38 
 
 		 258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  60 
 
 		 259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1957  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, ATP-binding component  63.86 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1155  ABC transporter related  59.06 
 
 		 266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6912  ABC transporter related  60.57 
 
 		 258 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4288  ABC transporter-like  63.56 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5012  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  65.04 
 
 		 259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5070  ABC transporter related  63.49 
 
 		 260 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  59.22 
 
 		 259 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  59.22 
 
 		 259 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6799  ABC transporter related  60.08 
 
 		 265 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.557054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  58.82 
 
 		 259 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4287  ABC transporter related  60.08 
 
 		 265 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0176  ABC transporter related  61.57 
 
 		 257 aa  310  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  58.47 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2166  ABC transporter related  58.89 
 
 		 261 aa  309  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000000402922  hitchhiker  0.000000271628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4483  basic amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.16 
 
 		 254 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1206  ABC transporter-like  59.6 
 
 		 254 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1556  ABC transporter related  59.27 
 
 		 263 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  60.08 
 
 		 259 aa  309  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1432  ABC transporter related  63.16 
 
 		 254 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172857  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1120  ABC transporter related  58.82 
 
 		 259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2221  putative amino acid ABC transporter  59.76 
 
 		 259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4842  ABC transporter related  59.68 
 
 		 265 aa  308  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463147  normal  0.18459 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0887  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.08 
 
 		 255 aa  308  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7501  ABC transporter related  57.37 
 
 		 273 aa  308  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1830  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  62.35 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  59.27 
 
 		 260 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2015  ABC transporter related  58.75 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3567  ABC transporter  62.35 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1245  histidine transport ATP-binding protein  59.68 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0371  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  58.75 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1087  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  59.68 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1092  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  59.68 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195395  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0744  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.27 
 
 		 255 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3015  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.27 
 
 		 255 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0526452  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0870  ABC transporter related  58.75 
 
 		 269 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>