More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3307 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  100 
 
 
256 aa  528  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003973  arginine/ornithine ABC transporter ATP-binding protein AotP  70.7 
 
 
256 aa  367  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  68 
 
 
268 aa  368  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01549  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.7 
 
 
256 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2781  ABC transporter related  69.84 
 
 
256 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1957  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, ATP-binding component  70.31 
 
 
256 aa  363  1e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1455  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.15 
 
 
256 aa  359  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0011921  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0338  ABC transporter related  65.86 
 
 
285 aa  353  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615822  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2649  ABC transporter related  66.27 
 
 
260 aa  352  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  65.2 
 
 
264 aa  348  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1259  ABC transporter related  65.6 
 
 
260 aa  345  5e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7501  ABC transporter related  63.92 
 
 
273 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  64.82 
 
 
254 aa  342  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  64.43 
 
 
254 aa  342  5e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  64.43 
 
 
263 aa  339  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  65.73 
 
 
264 aa  337  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1739  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  65.32 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.39 
 
 
257 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0589  arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  65.32 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2429  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  65.32 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2851  histidine transport ATP-binding protein  65.32 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2862  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  65.32 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2166  ABC transporter related  64.43 
 
 
261 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000000402922  hitchhiker  0.000000271628 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2789  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  65.32 
 
 
264 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.782335  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.92 
 
 
264 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2730  ABC-type histidine transport system, ATPase component  64.92 
 
 
264 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  62.99 
 
 
257 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  64.63 
 
 
258 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1059  ABC transporter related  65.32 
 
 
266 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1056  ABC transporter related  65.32 
 
 
266 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1556  ABC transporter related  64.29 
 
 
263 aa  335  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648429  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0698  ABC transporter related  65.32 
 
 
274 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1177  ABC transporter related  65.32 
 
 
274 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  62.02 
 
 
260 aa  333  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5734  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  64.52 
 
 
259 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.791565  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2452  ABC transporter related  64.11 
 
 
259 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0182129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  61.42 
 
 
257 aa  333  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1120  ABC transporter related  65.73 
 
 
259 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4911  ABC transporter  62.99 
 
 
257 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4289  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  63.64 
 
 
266 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  65.73 
 
 
259 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  62 
 
 
263 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1155  ABC transporter related  64.92 
 
 
266 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2317  ABC transporter related  64.11 
 
 
259 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.687012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  62 
 
 
263 aa  332  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  61.42 
 
 
257 aa  332  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  64.11 
 
 
259 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5070  ABC transporter related  65.87 
 
 
260 aa  329  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60072  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  64.11 
 
 
259 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  61.02 
 
 
257 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4622  arginine/ornithine transport protein AotP  65.99 
 
 
254 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  62 
 
 
265 aa  328  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52750  arginine/ornithine transport protein AotP  65.99 
 
 
254 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  63.71 
 
 
259 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  62 
 
 
265 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1245  histidine transport ATP-binding protein  63.71 
 
 
255 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1087  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  63.71 
 
 
255 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1092  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  63.71 
 
 
255 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195395  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0744  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.31 
 
 
255 aa  325  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1582  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.31 
 
 
255 aa  325  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0189341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0985  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.31 
 
 
255 aa  325  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3015  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.31 
 
 
255 aa  325  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0526452  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  63.71 
 
 
259 aa  325  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0887  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.9 
 
 
255 aa  325  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3988  ABC transporter related  65.59 
 
 
254 aa  324  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.929091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0283  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.2 
 
 
257 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  hitchhiker  0.000143941 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2925  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, ATPase subunit  64.29 
 
 
275 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628075  normal  0.276271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0301  ABC transporter related  62.2 
 
 
257 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal  0.0971272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0306  ABC transporter related  61.81 
 
 
257 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0328197  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1206  ABC transporter-like  64.11 
 
 
254 aa  322  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  60.71 
 
 
260 aa  322  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3772  ABC transporter related  64.78 
 
 
254 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446959  hitchhiker  0.00629002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3567  ABC transporter  64.37 
 
 
254 aa  322  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4927  ABC transporter related  61.81 
 
 
257 aa  321  6e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000746315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4288  ABC transporter-like  64.78 
 
 
254 aa  321  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1134  ABC transporter related  61.75 
 
 
260 aa  321  7e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1830  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  64.37 
 
 
254 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5748  ABC transporter related  62.3 
 
 
263 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  60.85 
 
 
255 aa  320  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4483  basic amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.78 
 
 
254 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.71 
 
 
254 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6594  ABC transporter related  62.3 
 
 
263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.147367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1432  ABC transporter related  64.78 
 
 
254 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172857  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6112  ABC transporter related  62.3 
 
 
263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3878  ABC transporter  63.31 
 
 
254 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999854  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5620  ABC transporter related  61.9 
 
 
263 aa  318  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33769  normal  0.48153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2558  ABC transporter related  65.84 
 
 
260 aa  318  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411241  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5837  ABC transporter related  61.9 
 
 
263 aa  318  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26210  ATP-binding component of histidine transport  67.21 
 
 
255 aa  318  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0271347  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1090  ABC transporter related  64.37 
 
 
254 aa  318  6e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455467  normal  0.0958562 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5103  ABC transporter related  63.2 
 
 
263 aa  318  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351754  hitchhiker  0.00435493 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5012  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  67.22 
 
 
259 aa  316  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  59.6 
 
 
275 aa  317  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4287  ABC transporter related  61.69 
 
 
265 aa  316  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485739  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2221  putative amino acid ABC transporter  61.96 
 
 
259 aa  316  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2913  ABC transporter related  63.16 
 
 
254 aa  316  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.289619 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4842  ABC transporter related  61.29 
 
 
265 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463147  normal  0.18459 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6912  ABC transporter related  60.73 
 
 
258 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2456  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  64.61 
 
 
257 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2600  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  64.61 
 
 
257 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0142427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>