More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5406 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  527  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  83.01 
 
 		 259 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  75.7 
 
 		 256 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  71.03 
 
 		 256 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  66.93 
 
 		 267 aa  345  4e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  65.62 
 
 		 263 aa  345  6e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  66.67 
 
 		 258 aa  335  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  65.22 
 
 		 273 aa  331  8e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.78 
 
 		 254 aa  329  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  66.13 
 
 		 254 aa  328  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  62.85 
 
 		 260 aa  327  8e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  61.85 
 
 		 254 aa  324  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  61.02 
 
 		 254 aa  321  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  63.92 
 
 		 276 aa  320  9.999999999999999e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  61.2 
 
 		 256 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  62.3 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  61.42 
 
 		 254 aa  318  5e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  60.85 
 
 		 260 aa  318  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  63.37 
 
 		 264 aa  318  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  61.6 
 
 		 250 aa  317  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  61.15 
 
 		 256 aa  317  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.8 
 
 		 260 aa  315  5e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  62.35 
 
 		 267 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  61.48 
 
 		 264 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  60 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  61.2 
 
 		 255 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  60.8 
 
 		 252 aa  311  9e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  58.3 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  57.81 
 
 		 268 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  59.84 
 
 		 254 aa  308  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  59.38 
 
 		 274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  57.48 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  58.98 
 
 		 274 aa  305  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  62.3 
 
 		 279 aa  304  8.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  57.14 
 
 		 263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  59.44 
 
 		 254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  58.89 
 
 		 263 aa  303  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.23 
 
 		 592 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  58.23 
 
 		 264 aa  301  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.63 
 
 		 595 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.63 
 
 		 594 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  59.04 
 
 		 598 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.36 
 
 		 597 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59.2 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.63 
 
 		 594 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  58.1 
 
 		 275 aa  299  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  55.97 
 
 		 274 aa  298  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  57.6 
 
 		 239 aa  298  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  60.57 
 
 		 602 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  60 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  56.98 
 
 		 597 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.98 
 
 		 597 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  58.23 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.39 
 
 		 268 aa  295  5e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  61.6 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  57.83 
 
 		 619 aa  294  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  58.4 
 
 		 240 aa  294  9e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  57.54 
 
 		 247 aa  293  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  57.2 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  57.54 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.1 
 
 		 299 aa  292  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  56.97 
 
 		 257 aa  291  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.63 
 
 		 595 aa  291  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.3 
 
 		 244 aa  291  8e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  55.56 
 
 		 254 aa  291  8e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.77 
 
 		 261 aa  291  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  59.2 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  56.81 
 
 		 636 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  56.81 
 
 		 636 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2971  ABC transporter related  56.69 
 
 		 254 aa  289  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  56.81 
 
 		 636 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  56.81 
 
 		 636 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  58 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  56.81 
 
 		 636 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.81 
 
 		 636 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  57.6 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  58.17 
 
 		 262 aa  289  3e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  56.13 
 
 		 272 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  56.63 
 
 		 261 aa  288  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  58.17 
 
 		 256 aa  288  7e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.98 
 
 		 273 aa  287  9e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  61.04 
 
 		 246 aa  287  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  56.5 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  55.16 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  58 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  56.42 
 
 		 636 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.91 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  56.08 
 
 		 256 aa  285  5.999999999999999e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  58.78 
 
 		 272 aa  285  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  56.4 
 
 		 248 aa  285  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  55.87 
 
 		 254 aa  284  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3275  ABC transporter related  55.51 
 
 		 259 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  56.91 
 
 		 254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  55.12 
 
 		 245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  56.8 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  55.21 
 
 		 267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  59.77 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  57.2 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0985  ABC transporter related protein  55.51 
 
 		 259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  55.6 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>