More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0227 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  100 
 
 
265 aa  542  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5219  ABC transporter related  83.67 
 
 
257 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  78.63 
 
 
253 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3083  glutamine/glutamate ABC transporter, ATP-binding protein  77.82 
 
 
253 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  65.99 
 
 
255 aa  345  5e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.59 
 
 
255 aa  344  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  65.15 
 
 
259 aa  337  8e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  61.63 
 
 
256 aa  337  9.999999999999999e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0663  SMR family multidrug efflux pump  63.07 
 
 
245 aa  333  2e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0289  general L-amino acid transport ATP-binding protein AapP  62.66 
 
 
245 aa  330  2e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0519  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.08 
 
 
245 aa  319  3e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0494  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.67 
 
 
245 aa  318  6e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000537818  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1470  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.26 
 
 
245 aa  318  7.999999999999999e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000837617  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0692  conserved hypothetical protein, ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family (ATP-binding protein)  59.67 
 
 
245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.611773  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.09 
 
 
252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.97 
 
 
244 aa  299  3e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  60.18 
 
 
251 aa  293  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  57.2 
 
 
249 aa  291  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  54.73 
 
 
244 aa  291  5e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  56.67 
 
 
242 aa  289  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.02 
 
 
244 aa  289  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.23 
 
 
242 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  55.74 
 
 
244 aa  288  9e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  55.04 
 
 
242 aa  287  1e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  58.58 
 
 
246 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  56.36 
 
 
249 aa  286  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  56.3 
 
 
244 aa  285  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  55.65 
 
 
246 aa  285  5e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  57.08 
 
 
242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  54.39 
 
 
262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  54.58 
 
 
252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 
244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  54.36 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  54.13 
 
 
266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  55.93 
 
 
249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  56.13 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  57.08 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  52.72 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  54.81 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.23 
 
 
242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.77 
 
 
257 aa  282  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  54.96 
 
 
243 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  54.39 
 
 
240 aa  281  6.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  53.75 
 
 
248 aa  281  6.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  53.78 
 
 
243 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  57.38 
 
 
249 aa  281  8.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 
240 aa  280  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  53.78 
 
 
247 aa  280  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 
240 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.3 
 
 
240 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 
240 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.3 
 
 
240 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  54.39 
 
 
241 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  53.33 
 
 
248 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  56.67 
 
 
255 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  52.72 
 
 
240 aa  280  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 
240 aa  279  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  55.04 
 
 
244 aa  279  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  54.77 
 
 
260 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  53.36 
 
 
240 aa  279  3e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  52.46 
 
 
248 aa  279  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  52.92 
 
 
242 aa  279  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  56.49 
 
 
242 aa  279  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 
240 aa  279  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 
240 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  55.65 
 
 
242 aa  278  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  55.6 
 
 
254 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  55.6 
 
 
254 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  53.78 
 
 
242 aa  278  6e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  54.13 
 
 
243 aa  278  7e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  55.6 
 
 
242 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  53.59 
 
 
242 aa  278  8e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.23 
 
 
240 aa  278  8e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  55.65 
 
 
244 aa  278  8e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  53.91 
 
 
260 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  53.53 
 
 
249 aa  278  9e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
251 aa  277  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  53.78 
 
 
263 aa  277  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  53.11 
 
 
261 aa  277  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.52 
 
 
240 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  53.94 
 
 
249 aa  277  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  52.89 
 
 
266 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  55.19 
 
 
244 aa  276  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.3 
 
 
240 aa  276  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  58.65 
 
 
261 aa  276  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  53.33 
 
 
259 aa  276  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.12 
 
 
247 aa  276  2e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  52.72 
 
 
246 aa  276  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.94 
 
 
260 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  53.14 
 
 
242 aa  276  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  53.36 
 
 
263 aa  276  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.72 
 
 
244 aa  276  3e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  54.01 
 
 
242 aa  276  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.11 
 
 
253 aa  275  4e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  53.94 
 
 
260 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  53.94 
 
 
255 aa  275  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0121  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.03 
 
 
246 aa  275  4e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  53.53 
 
 
258 aa  275  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  54.36 
 
 
243 aa  275  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>