More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2600 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  488  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  58.68 
 
 		 248 aa  285  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.68 
 
 		 248 aa  285  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  58.44 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  55.79 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  58.26 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  58.44 
 
 		 249 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  58.44 
 
 		 243 aa  281  6.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  58.02 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  58.09 
 
 		 245 aa  280  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  60.5 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  59.26 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  58.02 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  58.02 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  57.68 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  60.08 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  59.34 
 
 		 252 aa  278  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  57.26 
 
 		 243 aa  278  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  58.09 
 
 		 246 aa  278  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.24 
 
 		 244 aa  278  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  55.79 
 
 		 242 aa  275  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  55.14 
 
 		 256 aa  276  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  57.61 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  59.66 
 
 		 241 aa  275  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  58.09 
 
 		 244 aa  274  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  56.85 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  58.51 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  57.96 
 
 		 245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  56.79 
 
 		 247 aa  272  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  56.73 
 
 		 245 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  55.14 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  59.39 
 
 		 506 aa  269  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  56.73 
 
 		 245 aa  268  8e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  56.73 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  55.42 
 
 		 245 aa  265  4e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  54.58 
 
 		 247 aa  265  4e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  53.09 
 
 		 244 aa  265  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  55.88 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  56.9 
 
 		 246 aa  264  8e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  53.09 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  56.07 
 
 		 245 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  53.33 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  55.46 
 
 		 242 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  54.17 
 
 		 257 aa  262  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  55.23 
 
 		 248 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  55.24 
 
 		 248 aa  261  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  55.65 
 
 		 252 aa  261  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  54.81 
 
 		 244 aa  261  6.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  51.46 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  54.39 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 245 aa  259  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.11 
 
 		 244 aa  260  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.81 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  54.13 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  51.68 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  55.14 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  53.11 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.09 
 
 		 284 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  53.75 
 
 		 248 aa  258  6e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  53.36 
 
 		 257 aa  258  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  55.23 
 
 		 244 aa  258  7e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  55.83 
 
 		 259 aa  258  8e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  52.92 
 
 		 246 aa  258  8e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 242 aa  258  8e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.26 
 
 		 253 aa  257  9e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  51.9 
 
 		 252 aa  258  9e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 270 aa  257  1e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  54.29 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  56.07 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  55.26 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  53.09 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  52.48 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  53.69 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  54.17 
 
 		 243 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  54.51 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  53.56 
 
 		 243 aa  255  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  50.83 
 
 		 244 aa  255  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  56.3 
 
 		 259 aa  255  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 262 aa  255  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  52.08 
 
 		 252 aa  255  6e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  52.02 
 
 		 256 aa  254  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  54.36 
 
 		 243 aa  254  9e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  54.81 
 
 		 262 aa  254  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3697  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.19 
 
 		 242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270266  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  53.56 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.75 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6886  ABC transporter related  54.51 
 
 		 254 aa  253  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  53.09 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  52.08 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  55 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  56.79 
 
 		 253 aa  252  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  54.77 
 
 		 247 aa  252  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  52.92 
 
 		 246 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  54.2 
 
 		 242 aa  252  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  51.04 
 
 		 249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3562  ABC transporter related  56.3 
 
 		 257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  51.46 
 
 		 240 aa  251  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  54.96 
 
 		 243 aa  251  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  54.36 
 
 		 256 aa  251  6e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  52.67 
 
 		 244 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>