More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0446 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  100 
 
 
242 aa  494  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  73.44 
 
 
247 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  73.03 
 
 
243 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  71.78 
 
 
247 aa  363  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  71.78 
 
 
247 aa  363  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.95 
 
 
248 aa  362  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  70.95 
 
 
248 aa  362  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  68.88 
 
 
242 aa  357  8e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  70.54 
 
 
243 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  68.05 
 
 
243 aa  349  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  70.87 
 
 
506 aa  345  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  67.63 
 
 
245 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  67.63 
 
 
246 aa  340  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  68.33 
 
 
255 aa  338  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  66.39 
 
 
244 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.11 
 
 
244 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  65.69 
 
 
241 aa  332  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  65.27 
 
 
241 aa  327  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  64.58 
 
 
261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  63.64 
 
 
244 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  63.6 
 
 
241 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  63.97 
 
 
248 aa  320  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  65.7 
 
 
252 aa  319  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  63.82 
 
 
245 aa  319  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  62.66 
 
 
249 aa  318  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  63.01 
 
 
245 aa  317  7e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  62.24 
 
 
249 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  62.24 
 
 
249 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  63.41 
 
 
245 aa  316  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  63.01 
 
 
245 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  63.22 
 
 
252 aa  308  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  62.4 
 
 
252 aa  308  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  61.09 
 
 
244 aa  299  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  58.26 
 
 
243 aa  291  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  57.08 
 
 
243 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  56.67 
 
 
262 aa  288  6e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  57.92 
 
 
246 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.42 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  55 
 
 
243 aa  281  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  54.55 
 
 
247 aa  280  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.17 
 
 
244 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  55 
 
 
243 aa  278  5e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1059  ABC transporter related  57.72 
 
 
266 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1056  ABC transporter related  57.72 
 
 
266 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  55.79 
 
 
242 aa  278  8e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  57.72 
 
 
264 aa  277  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55 
 
 
242 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  55.37 
 
 
246 aa  277  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.42 
 
 
240 aa  277  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  55.79 
 
 
243 aa  275  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  275  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  55.88 
 
 
243 aa  275  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  55.88 
 
 
242 aa  275  6e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  53.72 
 
 
247 aa  275  6e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  54.17 
 
 
243 aa  275  7e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.91 
 
 
264 aa  274  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1155  ABC transporter related  56.91 
 
 
266 aa  274  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  55.83 
 
 
239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4289  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  56.91 
 
 
266 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  55.46 
 
 
239 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0698  ABC transporter related  56.91 
 
 
274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  52.92 
 
 
242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1177  ABC transporter related  56.91 
 
 
274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  54.55 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  53.91 
 
 
243 aa  272  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.08 
 
 
240 aa  272  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3878  ABC transporter  53.75 
 
 
254 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999854  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  55.42 
 
 
262 aa  271  9e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  54.17 
 
 
240 aa  271  9e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  53.94 
 
 
249 aa  271  9e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  55.65 
 
 
253 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  53.16 
 
 
248 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  56.1 
 
 
259 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  53.97 
 
 
249 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  54.17 
 
 
240 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  51.05 
 
 
265 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  51.85 
 
 
248 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  52.32 
 
 
248 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  52.65 
 
 
256 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  56.1 
 
 
259 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  56.85 
 
 
242 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  56.1 
 
 
259 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1739  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  55.69 
 
 
264 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0589  arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.69 
 
 
264 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2851  histidine transport ATP-binding protein  55.69 
 
 
264 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  54.92 
 
 
260 aa  268  4e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  53.97 
 
 
244 aa  269  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2429  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  55.69 
 
 
264 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2862  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  55.69 
 
 
264 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  51.67 
 
 
241 aa  269  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  52.48 
 
 
244 aa  268  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  53.33 
 
 
241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.96 
 
 
254 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  55.42 
 
 
243 aa  268  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1206  ABC transporter-like  55.1 
 
 
254 aa  268  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  56.1 
 
 
259 aa  268  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  53.94 
 
 
243 aa  267  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  52.5 
 
 
251 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  53.75 
 
 
240 aa  267  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  55.46 
 
 
241 aa  267  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>