More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1048 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  100 
 
 		 249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  71.13 
 
 		 250 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  68.46 
 
 		 260 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3307  ABC transporter related  69.46 
 
 		 259 aa  347  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  68.88 
 
 		 260 aa  345  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2431  polar amino acid ABC transporter ATPase  63.6 
 
 		 256 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59.02 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  56.63 
 
 		 249 aa  294  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  59.07 
 
 		 240 aa  293  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  58.65 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  57.87 
 
 		 240 aa  289  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  57.87 
 
 		 242 aa  288  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5772  ABC transporter related  57.43 
 
 		 336 aa  288  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21470  amino acid ABC transporter, ATP binding component  58.51 
 
 		 269 aa  287  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  58.62 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  59.41 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  58.72 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  58.58 
 
 		 246 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  58.62 
 
 		 243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5173  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  57.2 
 
 		 261 aa  282  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  56.8 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  56.12 
 
 		 267 aa  281  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  58.19 
 
 		 243 aa  281  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  56.49 
 
 		 239 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2630  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 		 278 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00585721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  57.02 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  54.47 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  57.43 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  54.85 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.12 
 
 		 269 aa  279  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.12 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  56.6 
 
 		 240 aa  279  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  56.12 
 
 		 269 aa  278  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  55.27 
 
 		 246 aa  278  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  56.49 
 
 		 240 aa  278  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  53.53 
 
 		 265 aa  278  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 247 aa  278  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.41 
 
 		 244 aa  277  9e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  53.75 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  54.81 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  56.07 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  56.9 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  56.9 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  56.54 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  60.18 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  56.49 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  54.44 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  55.27 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  57.32 
 
 		 246 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  54.01 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.01 
 
 		 246 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  59.73 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.7 
 
 		 249 aa  275  5e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  55.7 
 
 		 240 aa  275  6e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  55.27 
 
 		 249 aa  275  6e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  56.17 
 
 		 244 aa  275  6e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  52.21 
 
 		 250 aa  274  8e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  57.02 
 
 		 243 aa  274  8e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.14 
 
 		 242 aa  274  8e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 240 aa  274  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  55.7 
 
 		 249 aa  274  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  55.88 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.27 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  55.27 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  54.01 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  56.54 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  53.59 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  55.74 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  54.01 
 
 		 263 aa  273  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.17 
 
 		 273 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  55.23 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  55.88 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  53.53 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  55.79 
 
 		 273 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  54.01 
 
 		 249 aa  272  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  54.85 
 
 		 240 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.85 
 
 		 240 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  55.65 
 
 		 258 aa  271  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  53.14 
 
 		 246 aa  271  8.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  56.91 
 
 		 242 aa  271  9e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.88 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1702  ABC transporter related  52.61 
 
 		 253 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.478201 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  56.36 
 
 		 248 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  55.56 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  53.59 
 
 		 242 aa  271  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 		 251 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.88 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  56.02 
 
 		 267 aa  270  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.46 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.88 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.88 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  57.02 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  57.14 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  53.56 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  53.53 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  55.7 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  50.58 
 
 		 259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>