More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1540 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  67.59 
 
 		 255 aa  363  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.87 
 
 		 255 aa  360  8e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  67.49 
 
 		 259 aa  353  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  64.52 
 
 		 253 aa  341  8e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3083  glutamine/glutamate ABC transporter, ATP-binding protein  64.92 
 
 		 253 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  61.63 
 
 		 265 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0663  SMR family multidrug efflux pump  63.67 
 
 		 245 aa  329  2e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1470  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.15 
 
 		 245 aa  327  9e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000837617  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0494  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.15 
 
 		 245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000537818  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0519  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.15 
 
 		 245 aa  326  3e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0289  general L-amino acid transport ATP-binding protein AapP  61.22 
 
 		 245 aa  322  3e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0692  conserved hypothetical protein, ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family (ATP-binding protein)  62.66 
 
 		 245 aa  316  2e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.611773  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5219  ABC transporter related  58.7 
 
 		 257 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.96 
 
 		 252 aa  305  3e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  61.89 
 
 		 251 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0121  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.69 
 
 		 246 aa  294  1e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0447  ABC transporter related  57.49 
 
 		 251 aa  284  9e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0093  amino acid ABC transporter ATPase  57.14 
 
 		 263 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  54.47 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  52.87 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  52.89 
 
 		 244 aa  276  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  52.65 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  55.23 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  53.36 
 
 		 241 aa  275  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.77 
 
 		 253 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  54.62 
 
 		 243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1839  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  55.19 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3013  ABC transporter related  55.19 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2923  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  55.19 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.524102  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  53.94 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.78 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  55.04 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  52.48 
 
 		 244 aa  273  3e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  53.33 
 
 		 248 aa  272  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0719  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  55.19 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  51.68 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  53.14 
 
 		 264 aa  271  6e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3142  ABC transporter related protein  54.77 
 
 		 241 aa  271  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1189  ABC transporter related  54.77 
 
 		 241 aa  271  7e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  54.62 
 
 		 243 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.36 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0766  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  54.77 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.53 
 
 		 284 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0779  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  54.77 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  55.88 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  52.92 
 
 		 248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0815  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  54.77 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  53.56 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0705  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  54.77 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2974  ABC transporter related protein  54.36 
 
 		 241 aa  269  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6962  ABC transporter related  51.87 
 
 		 241 aa  269  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0680  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  54.36 
 
 		 241 aa  269  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0744  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  54.36 
 
 		 241 aa  269  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2993  ABC transporter related  54.36 
 
 		 241 aa  269  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0697  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  54.36 
 
 		 241 aa  269  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  53.31 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.37 
 
 		 244 aa  268  5e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  53.11 
 
 		 249 aa  268  7e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.88 
 
 		 240 aa  268  7e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  50.4 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.08 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  53.56 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.08 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  51.26 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.08 
 
 		 240 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.04 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.08 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0673  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  54.77 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  53.11 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  51.26 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  48.74 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.04 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1211  ABC transporter-related protein  53.11 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  51.87 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  48.78 
 
 		 269 aa  265  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  49.59 
 
 		 251 aa  265  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  52.3 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  51.48 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  51.24 
 
 		 244 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  53.53 
 
 		 242 aa  265  7e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 		 240 aa  265  8e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  51.67 
 
 		 240 aa  265  8e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 240 aa  265  8e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 		 240 aa  265  8e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 		 240 aa  265  8e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 		 240 aa  265  8e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  51.67 
 
 		 240 aa  265  8e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  52.07 
 
 		 242 aa  263  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>