More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1748 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1748  ABC transporter related  100 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4597  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP- binding protein  60.71 
 
 		 271 aa  314  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4371  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  59.55 
 
 		 277 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3869  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  60.71 
 
 		 295 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4425  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.56 
 
 		 255 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3462  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  56.63 
 
 		 282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2156  ABC transporter related  56.62 
 
 		 267 aa  302  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5218  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  57.25 
 
 		 278 aa  301  8.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0306  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  56.51 
 
 		 267 aa  298  4e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137592  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3700  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  56.92 
 
 		 261 aa  298  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.52 
 
 		 274 aa  296  4e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0380477  normal  0.0820777 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5514  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  56.69 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.595344  hitchhiker  0.000996868 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0280  ABC transporter related  57.31 
 
 		 261 aa  292  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5235  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  56.35 
 
 		 261 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.251626 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0669  ABC transporter related  57.49 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0798533 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  56.75 
 
 		 254 aa  282  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3170  hypothetical protein  56.13 
 
 		 261 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07290  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.79 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29460  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 		 254 aa  279  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0064  polar amino acid ABC transporter ATPase  53.75 
 
 		 261 aa  278  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  54.76 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  54.62 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  56.63 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2323  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  54.76 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483469  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  54.18 
 
 		 250 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  54.94 
 
 		 245 aa  271  7e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  54.58 
 
 		 250 aa  271  7e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  55.73 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  53.17 
 
 		 263 aa  269  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.16 
 
 		 267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  54.25 
 
 		 258 aa  268  8e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  54.18 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  52.96 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.18 
 
 		 254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  53.75 
 
 		 256 aa  265  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  52.57 
 
 		 260 aa  265  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  53.39 
 
 		 245 aa  264  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  54.18 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  52.19 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  53.97 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  55.38 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  53.78 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  53.75 
 
 		 263 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  52.78 
 
 		 260 aa  262  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  52.99 
 
 		 243 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2965  ABC transporter  52.61 
 
 		 265 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0568085  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  51.72 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  51.17 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  51.72 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  53.47 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  55.24 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  53.17 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  53.01 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  53.2 
 
 		 243 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  52.61 
 
 		 242 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3163  ABC transporter related  52.36 
 
 		 272 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.816893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  52.12 
 
 		 273 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  52.99 
 
 		 243 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.39 
 
 		 244 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  51.67 
 
 		 274 aa  258  9e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  52.78 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.69 
 
 		 267 aa  257  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52 
 
 		 592 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.84 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  52.19 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  53.01 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  54.22 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  53.41 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  51 
 
 		 247 aa  257  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  52.8 
 
 		 254 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  53.17 
 
 		 244 aa  257  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  51.79 
 
 		 254 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  51.61 
 
 		 363 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  52.38 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  52.8 
 
 		 243 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  50 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  51.81 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  51.98 
 
 		 267 aa  256  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  52.59 
 
 		 257 aa  255  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  52.24 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  52.19 
 
 		 242 aa  255  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  51.41 
 
 		 251 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  50.59 
 
 		 246 aa  255  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  52.99 
 
 		 255 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  52.19 
 
 		 242 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  51.79 
 
 		 242 aa  254  8e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  51.94 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  54.47 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  53.2 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  52.94 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  50 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  51.6 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  51.95 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.39 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  53.41 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  49.8 
 
 		 252 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  51 
 
 		 241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>