More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0064 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0064  polar amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 
261 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5514  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  82.76 
 
 
261 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.595344  hitchhiker  0.000996868 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5235  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  81.99 
 
 
261 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.251626 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3700  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  80.46 
 
 
261 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3170  hypothetical protein  78.54 
 
 
261 aa  417  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0280  ABC transporter related  74.71 
 
 
261 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3869  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  59.52 
 
 
295 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2156  ABC transporter related  57.87 
 
 
267 aa  311  5.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4371  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  58.43 
 
 
277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2323  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  57.81 
 
 
257 aa  305  5.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483469  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0306  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  60.47 
 
 
267 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4597  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP- binding protein  57.71 
 
 
271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4425  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.57 
 
 
255 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  57.54 
 
 
282 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29460  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.97 
 
 
254 aa  298  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.35 
 
 
274 aa  291  1e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0380477  normal  0.0820777 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5218  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  56.64 
 
 
278 aa  289  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3462  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  56.08 
 
 
254 aa  285  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  56.57 
 
 
254 aa  281  9e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07290  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 
245 aa  278  6e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1748  ABC transporter related  53.75 
 
 
271 aa  278  8e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  54.33 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  52.16 
 
 
254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  54.55 
 
 
246 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  55.29 
 
 
257 aa  271  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  53.75 
 
 
246 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  52.59 
 
 
250 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  54.69 
 
 
263 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  55.04 
 
 
252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  54.76 
 
 
255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  52.19 
 
 
250 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  53.36 
 
 
259 aa  268  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  55.38 
 
 
240 aa  268  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  52.38 
 
 
260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  51.78 
 
 
260 aa  266  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  52.96 
 
 
247 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  53.73 
 
 
245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  51.18 
 
 
259 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  51.39 
 
 
268 aa  264  8e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  51.59 
 
 
256 aa  264  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  53.2 
 
 
247 aa  263  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  52.19 
 
 
256 aa  263  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6680  ABC transporter related  54.72 
 
 
250 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  51.37 
 
 
254 aa  262  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  52.23 
 
 
254 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 
240 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  54.84 
 
 
255 aa  262  4.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  52.96 
 
 
243 aa  261  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  52.57 
 
 
262 aa  261  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  56.8 
 
 
257 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  53.36 
 
 
257 aa  261  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  53.17 
 
 
250 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  51.79 
 
 
242 aa  261  8.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  51.59 
 
 
242 aa  260  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  52.96 
 
 
252 aa  260  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  54.51 
 
 
244 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  52.16 
 
 
254 aa  260  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  52.78 
 
 
263 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  51.78 
 
 
270 aa  259  3e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  51.92 
 
 
274 aa  259  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  53.36 
 
 
248 aa  258  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  53.75 
 
 
240 aa  258  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0669  ABC transporter related  52.67 
 
 
247 aa  258  8e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0798533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
267 aa  258  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3107  ABC transporter related  53.52 
 
 
245 aa  258  9e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  53.6 
 
 
243 aa  258  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  52.96 
 
 
246 aa  258  9e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  52.19 
 
 
240 aa  257  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  52.03 
 
 
254 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  50.79 
 
 
254 aa  257  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  53.78 
 
 
244 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  52.57 
 
 
248 aa  256  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  51.79 
 
 
242 aa  256  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  54.58 
 
 
243 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  52.57 
 
 
251 aa  255  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  51.2 
 
 
250 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  52.57 
 
 
248 aa  255  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  51.39 
 
 
258 aa  255  6e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  54.18 
 
 
240 aa  254  7e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  48.81 
 
 
248 aa  254  7e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  51.78 
 
 
244 aa  254  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  51.98 
 
 
259 aa  254  8e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  51 
 
 
249 aa  254  9e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  52.57 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  53.17 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  51 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  51.76 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.78 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  53.6 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  55.16 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  54 
 
 
246 aa  253  3e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0210  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.41 
 
 
248 aa  253  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.770881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  50.99 
 
 
258 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  52.21 
 
 
254 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0257  ATP-binding protein  51.41 
 
 
248 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000197314 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0850  ATPase  51.39 
 
 
246 aa  252  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.736744  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  51.57 
 
 
243 aa  252  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  50.2 
 
 
243 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.19 
 
 
257 aa  252  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  52.59 
 
 
242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>