More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0306 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0306  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  100 
 
 		 267 aa  537  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137592  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5218  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  79.13 
 
 		 278 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4597  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP- binding protein  69.32 
 
 		 271 aa  377  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29460  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.43 
 
 		 254 aa  359  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0669  ABC transporter related  67.62 
 
 		 247 aa  330  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0798533 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.34 
 
 		 274 aa  326  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0380477  normal  0.0820777 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07290  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.31 
 
 		 245 aa  322  6e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3869  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  57.36 
 
 		 295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4371  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 		 277 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3700  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 		 261 aa  308  9e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0064  polar amino acid ABC transporter ATPase  60.47 
 
 		 261 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684363 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3462  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  59.76 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0280  ABC transporter related  60.08 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5514  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  60.08 
 
 		 261 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.595344  hitchhiker  0.000996868 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1748  ABC transporter related  56.51 
 
 		 271 aa  298  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5235  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 		 261 aa  298  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.251626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2323  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  57.94 
 
 		 257 aa  295  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483469  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2156  ABC transporter related  53.79 
 
 		 267 aa  295  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4425  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.37 
 
 		 255 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3170  hypothetical protein  58.1 
 
 		 261 aa  285  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  54.15 
 
 		 254 aa  261  8.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  52.38 
 
 		 254 aa  259  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2965  ABC transporter  53.01 
 
 		 265 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0568085  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  53.75 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  50.19 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  51.17 
 
 		 261 aa  251  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.4 
 
 		 592 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  51.79 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  49.6 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  49.8 
 
 		 259 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  52.19 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  48.26 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  50 
 
 		 242 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  50.6 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  50.61 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  48.85 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  53.23 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  50.99 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  52.23 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  48.02 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.75 
 
 		 260 aa  246  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 		 254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  49.81 
 
 		 636 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  49.81 
 
 		 636 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  49.81 
 
 		 636 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.81 
 
 		 636 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  47.67 
 
 		 267 aa  245  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  50.2 
 
 		 255 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52 
 
 		 636 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  49.2 
 
 		 256 aa  244  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  52 
 
 		 636 aa  244  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  50.4 
 
 		 268 aa  244  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 273 aa  244  9e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  51.19 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  50.98 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  49.61 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  47.41 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  49.6 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  47.81 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  52.59 
 
 		 240 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  52.48 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  50.94 
 
 		 266 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  51.6 
 
 		 636 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  49.81 
 
 		 274 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  51.25 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  49.6 
 
 		 363 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  50.19 
 
 		 266 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  49.4 
 
 		 256 aa  241  6e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  49.41 
 
 		 254 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  50.39 
 
 		 254 aa  241  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  47.47 
 
 		 286 aa  241  7e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  55.33 
 
 		 253 aa  241  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  48.65 
 
 		 261 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.2 
 
 		 261 aa  241  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  49.8 
 
 		 248 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  49.42 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.6 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.63 
 
 		 594 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50.99 
 
 		 244 aa  240  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  51.79 
 
 		 244 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.2 
 
 		 595 aa  240  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.22 
 
 		 594 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.63 
 
 		 595 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.18 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.43 
 
 		 597 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  49.4 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  49.2 
 
 		 363 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  50.2 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  50.59 
 
 		 245 aa  239  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  48.21 
 
 		 240 aa  238  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>