More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29460 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29460  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4597  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP- binding protein  72.4 
 
 		 271 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0306  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  71.43 
 
 		 267 aa  359  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137592  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5218  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  70.87 
 
 		 278 aa  359  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.8 
 
 		 274 aa  340  1e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0380477  normal  0.0820777 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0669  ABC transporter related  65.31 
 
 		 247 aa  325  3e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0798533 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07290  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.31 
 
 		 245 aa  325  5e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3869  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  60.4 
 
 		 295 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2323  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  58.57 
 
 		 257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483469  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0280  ABC transporter related  60.56 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3462  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 		 254 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3700  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  58.57 
 
 		 261 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0064  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.97 
 
 		 261 aa  298  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5514  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  58.57 
 
 		 261 aa  295  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.595344  hitchhiker  0.000996868 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3170  hypothetical protein  59.36 
 
 		 261 aa  295  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4371  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  58 
 
 		 277 aa  293  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4425  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.56 
 
 		 255 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5235  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  57.77 
 
 		 261 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.251626 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2156  ABC transporter related  54.4 
 
 		 267 aa  288  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1748  ABC transporter related  55.56 
 
 		 271 aa  279  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  54.25 
 
 		 282 aa  278  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2965  ABC transporter  53.97 
 
 		 265 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0568085  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  52.78 
 
 		 263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  51.79 
 
 		 240 aa  254  8e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  53.75 
 
 		 269 aa  251  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  51.63 
 
 		 254 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.6 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  51.01 
 
 		 254 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  52.36 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  52.24 
 
 		 263 aa  249  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.4 
 
 		 592 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  51.97 
 
 		 266 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1137  ABC transporter related  53.44 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.69 
 
 		 581 aa  249  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  52.61 
 
 		 264 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  50.8 
 
 		 254 aa  248  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.8 
 
 		 595 aa  248  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 240 aa  248  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  50 
 
 		 268 aa  248  8e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  52.24 
 
 		 289 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  52.19 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  51.85 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1120  ABC transporter related  52.21 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  51.21 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  50.4 
 
 		 261 aa  246  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  50.2 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  53.53 
 
 		 258 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  50.2 
 
 		 242 aa  246  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  52.24 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  51.79 
 
 		 240 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.65 
 
 		 597 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 240 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  51.41 
 
 		 259 aa  245  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  51 
 
 		 241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  51 
 
 		 241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  51 
 
 		 241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.21 
 
 		 244 aa  245  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  51.79 
 
 		 245 aa  244  6.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51 
 
 		 241 aa  244  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  51.6 
 
 		 254 aa  244  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.47 
 
 		 246 aa  244  9e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.21 
 
 		 244 aa  244  9e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  51 
 
 		 241 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 242 aa  244  9e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  51.82 
 
 		 248 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  51 
 
 		 241 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.81 
 
 		 244 aa  244  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  48.61 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.21 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  48.61 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  49.39 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.21 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  52.59 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 240 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1155  ABC transporter related  51.84 
 
 		 266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.81 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  51.43 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  49.42 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.21 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  51 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.03 
 
 		 595 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  52.24 
 
 		 597 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  48.61 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  50.6 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  52.67 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.69 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1533  ABC transporter related  50.6 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.24 
 
 		 597 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  48.61 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.21 
 
 		 244 aa  243  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  47.41 
 
 		 260 aa  242  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.84 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>