More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4597 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4597  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP- binding protein  100 
 
 		 271 aa  548  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5218  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  75 
 
 		 278 aa  384  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0306  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  69.32 
 
 		 267 aa  377  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137592  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29460  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  72.4 
 
 		 254 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.89 
 
 		 274 aa  344  8e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0380477  normal  0.0820777 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07290  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.57 
 
 		 245 aa  336  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0669  ABC transporter related  64.9 
 
 		 247 aa  323  3e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0798533 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3869  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  57.09 
 
 		 295 aa  315  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1748  ABC transporter related  60.71 
 
 		 271 aa  314  8e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0280  ABC transporter related  59.68 
 
 		 261 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4371  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 		 277 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3700  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  58.89 
 
 		 261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2156  ABC transporter related  56.3 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3462  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5514  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  58.5 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.595344  hitchhiker  0.000996868 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0064  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.71 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684363 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3170  hypothetical protein  58.5 
 
 		 261 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  53.96 
 
 		 282 aa  299  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5235  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  57.71 
 
 		 261 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.251626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2323  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  56.47 
 
 		 257 aa  295  8e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483469  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4425  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  53.23 
 
 		 263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  54.94 
 
 		 254 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  52.51 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  54.8 
 
 		 250 aa  275  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  54.75 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  54 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  52.8 
 
 		 256 aa  270  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  53.17 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  56 
 
 		 246 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  56.13 
 
 		 264 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  52.14 
 
 		 260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  54.03 
 
 		 256 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  50.99 
 
 		 261 aa  268  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  54.88 
 
 		 258 aa  268  8e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  54.44 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  54.8 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.59 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  52.12 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  54.18 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  55.79 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  52.73 
 
 		 279 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  53.39 
 
 		 263 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  54.37 
 
 		 254 aa  262  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  53.2 
 
 		 268 aa  260  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  49.63 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  53.25 
 
 		 255 aa  259  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  51.6 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  53.66 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  49.06 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  52.99 
 
 		 242 aa  259  4e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  51.59 
 
 		 254 aa  258  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  50.77 
 
 		 257 aa  258  9e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  52.96 
 
 		 244 aa  258  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0713  ABC transporter related  50.39 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0745  ABC transporter related  50.39 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  52.14 
 
 		 254 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  52.94 
 
 		 274 aa  256  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  52.21 
 
 		 243 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  50.59 
 
 		 252 aa  255  4e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.8 
 
 		 254 aa  255  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  52.19 
 
 		 242 aa  255  7e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2965  ABC transporter  50.79 
 
 		 265 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0568085  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  49.4 
 
 		 255 aa  254  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  49.4 
 
 		 267 aa  254  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.6 
 
 		 244 aa  254  8e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  54 
 
 		 249 aa  254  8e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  50.8 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  51.79 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2781  ABC transporter related  51.24 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  50.98 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.03 
 
 		 260 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 		 592 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  50 
 
 		 261 aa  251  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 		 240 aa  251  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  50.8 
 
 		 245 aa  251  7e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  52.19 
 
 		 244 aa  251  7e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  50.8 
 
 		 240 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  51.41 
 
 		 243 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  48.88 
 
 		 267 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 		 240 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  48.48 
 
 		 269 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  52 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.98 
 
 		 244 aa  249  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.91 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  52.07 
 
 		 254 aa  249  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  51.6 
 
 		 241 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  51.6 
 
 		 241 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  51.6 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  48.85 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  51.82 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  51 
 
 		 243 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  48.66 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  49.41 
 
 		 257 aa  249  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>