More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3462 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3462  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
254 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4371  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  62.45 
 
 
277 aa  331  9e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3869  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  62.06 
 
 
295 aa  325  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5218  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  63.24 
 
 
278 aa  314  7e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4425  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.96 
 
 
255 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2156  ABC transporter related  57.6 
 
 
267 aa  308  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4597  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP- binding protein  60 
 
 
271 aa  305  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0280  ABC transporter related  60.39 
 
 
261 aa  305  6e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2323  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 
257 aa  304  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483469  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0306  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  59.76 
 
 
267 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1748  ABC transporter related  59.68 
 
 
271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29460  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 
254 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5514  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  56.47 
 
 
261 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.595344  hitchhiker  0.000996868 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3170  hypothetical protein  59.22 
 
 
261 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 
282 aa  292  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3700  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  56.08 
 
 
261 aa  291  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5235  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  55.69 
 
 
261 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.251626 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07290  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.5 
 
 
245 aa  286  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0064  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.08 
 
 
261 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  56.69 
 
 
263 aa  277  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.6 
 
 
274 aa  276  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0380477  normal  0.0820777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2965  ABC transporter  55.34 
 
 
265 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0568085  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  55.43 
 
 
263 aa  276  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0669  ABC transporter related  55.74 
 
 
247 aa  274  8e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0798533 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  53.54 
 
 
254 aa  271  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  54.33 
 
 
245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  54.58 
 
 
244 aa  266  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  56 
 
 
240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.8 
 
 
278 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  53.97 
 
 
256 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  54.12 
 
 
254 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  53.6 
 
 
257 aa  265  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  54.4 
 
 
240 aa  265  7e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  52.96 
 
 
247 aa  265  8e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  52.17 
 
 
246 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  53.73 
 
 
254 aa  264  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  54.18 
 
 
243 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  53.54 
 
 
245 aa  263  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  54.22 
 
 
250 aa  262  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  54.98 
 
 
245 aa  262  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  54.58 
 
 
250 aa  262  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.22 
 
 
250 aa  262  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  54.4 
 
 
240 aa  262  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.22 
 
 
250 aa  262  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.22 
 
 
250 aa  262  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
240 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  54.4 
 
 
242 aa  261  4.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.22 
 
 
250 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  54.18 
 
 
250 aa  261  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  53.2 
 
 
240 aa  261  6e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  54.47 
 
 
242 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  52.38 
 
 
260 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.82 
 
 
250 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  54.4 
 
 
242 aa  261  8.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.22 
 
 
250 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.2 
 
 
240 aa  260  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  52.36 
 
 
254 aa  260  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  53.94 
 
 
256 aa  260  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.2 
 
 
592 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.62 
 
 
250 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.62 
 
 
250 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.62 
 
 
250 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  54.12 
 
 
255 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.62 
 
 
250 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.18 
 
 
595 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  52.8 
 
 
241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.82 
 
 
250 aa  258  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  53.6 
 
 
252 aa  258  7e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  53.85 
 
 
275 aa  257  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  53.85 
 
 
265 aa  257  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  52.59 
 
 
269 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  52.99 
 
 
255 aa  256  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  55.2 
 
 
248 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.22 
 
 
250 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  52.78 
 
 
243 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  54.4 
 
 
254 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  54.4 
 
 
240 aa  255  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.4 
 
 
240 aa  255  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  54.66 
 
 
260 aa  255  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  50 
 
 
244 aa  255  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.4 
 
 
252 aa  254  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  52.38 
 
 
263 aa  254  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  53.54 
 
 
244 aa  254  7e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  51.6 
 
 
244 aa  254  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.4 
 
 
252 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.4 
 
 
252 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  53.04 
 
 
265 aa  254  8e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6680  ABC transporter related  51.78 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.63 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.4 
 
 
597 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  53.57 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13310  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.53 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  52.4 
 
 
243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1231  ABC transporter related  51.76 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.903047  normal  0.0835348 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  51.37 
 
 
267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.63 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  52.8 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.18 
 
 
244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  52.85 
 
 
261 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  51.6 
 
 
251 aa  252  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>