More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3709 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  100 
 
 
268 aa  536  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  87.87 
 
 
274 aa  471  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  69.08 
 
 
598 aa  352  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.33 
 
 
254 aa  351  7e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.38 
 
 
261 aa  351  7e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  65.76 
 
 
261 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.38 
 
 
260 aa  349  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  66.54 
 
 
272 aa  348  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  66.28 
 
 
619 aa  348  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.27 
 
 
594 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.27 
 
 
594 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  67.33 
 
 
636 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.27 
 
 
595 aa  343  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  67.47 
 
 
636 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  67.33 
 
 
636 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  67.47 
 
 
636 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  67.47 
 
 
636 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  67.47 
 
 
636 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.27 
 
 
592 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.8 
 
 
597 aa  341  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  66.8 
 
 
597 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  66.67 
 
 
264 aa  340  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.8 
 
 
597 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  66.53 
 
 
636 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  61.69 
 
 
263 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  64.43 
 
 
254 aa  337  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  64.43 
 
 
275 aa  335  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  65.06 
 
 
258 aa  335  5e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  67.84 
 
 
602 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.88 
 
 
595 aa  333  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  61.69 
 
 
274 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  61.3 
 
 
274 aa  331  6e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  61.39 
 
 
260 aa  332  6e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  63.67 
 
 
257 aa  331  7.000000000000001e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  61.39 
 
 
260 aa  330  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  63.1 
 
 
264 aa  329  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  60.92 
 
 
267 aa  328  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.86 
 
 
299 aa  328  6e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  61.15 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  63.43 
 
 
279 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 
254 aa  326  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  62.11 
 
 
272 aa  325  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  60 
 
 
273 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  62.06 
 
 
254 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  61.81 
 
 
256 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  62.4 
 
 
250 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  62.8 
 
 
252 aa  319  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  61.6 
 
 
250 aa  318  6e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  60.64 
 
 
253 aa  316  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  60.32 
 
 
254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  61.75 
 
 
256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  60.24 
 
 
254 aa  310  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  58.57 
 
 
254 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  57.81 
 
 
259 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  60.4 
 
 
259 aa  308  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  57.6 
 
 
256 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  60.98 
 
 
263 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  61.18 
 
 
262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  61.73 
 
 
254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.45 
 
 
581 aa  304  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  57.6 
 
 
256 aa  300  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  58.1 
 
 
267 aa  297  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  59.68 
 
 
256 aa  297  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  56.75 
 
 
263 aa  297  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  57.71 
 
 
255 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.93 
 
 
276 aa  295  5e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  57.71 
 
 
263 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.2 
 
 
250 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  58.23 
 
 
254 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  54.65 
 
 
261 aa  292  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  57.03 
 
 
256 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  57.55 
 
 
249 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  55.34 
 
 
246 aa  289  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56 
 
 
244 aa  289  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  57.2 
 
 
262 aa  289  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  54.98 
 
 
242 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.82 
 
 
268 aa  288  9e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.29 
 
 
244 aa  288  9e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  58.89 
 
 
262 aa  288  9e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  58.2 
 
 
252 aa  286  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  54.8 
 
 
240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3107  ABC transporter related  58.04 
 
 
245 aa  285  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  54.72 
 
 
252 aa  285  7e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  54.96 
 
 
249 aa  285  7e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 
240 aa  284  9e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  56.7 
 
 
255 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.21 
 
 
255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.58 
 
 
244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  56.64 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  52.69 
 
 
267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  54.15 
 
 
254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.78 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 
244 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.2 
 
 
244 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.8 
 
 
242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.57 
 
 
249 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.1 
 
 
244 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.78 
 
 
244 aa  282  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  55.12 
 
 
247 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  55.38 
 
 
254 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>