More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3107 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3107  ABC transporter related  100 
 
 
245 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6680  ABC transporter related  79.92 
 
 
250 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  60.74 
 
 
240 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  60.33 
 
 
240 aa  291  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  60.33 
 
 
240 aa  291  9e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  59.66 
 
 
239 aa  286  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  58.04 
 
 
268 aa  285  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  57.71 
 
 
263 aa  285  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  58.92 
 
 
242 aa  285  5.999999999999999e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  56.07 
 
 
240 aa  279  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  58.2 
 
 
260 aa  279  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  59 
 
 
240 aa  279  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  58.92 
 
 
244 aa  278  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  56.56 
 
 
248 aa  278  8e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  54.36 
 
 
242 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  56.9 
 
 
243 aa  277  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  55.33 
 
 
246 aa  276  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  58.51 
 
 
249 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  58.26 
 
 
255 aa  275  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  55.56 
 
 
259 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  56.33 
 
 
245 aa  275  7e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  56.15 
 
 
274 aa  275  7e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  58.16 
 
 
240 aa  274  9e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  56.22 
 
 
267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.79 
 
 
244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  55 
 
 
241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  56.4 
 
 
245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 
240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  56.9 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  55.12 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  56.61 
 
 
243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  54.32 
 
 
246 aa  272  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  55.74 
 
 
256 aa  272  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  56.73 
 
 
252 aa  272  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  55.6 
 
 
242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.49 
 
 
244 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  57.14 
 
 
245 aa  271  8.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  57.68 
 
 
244 aa  271  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  56.2 
 
 
244 aa  271  9e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.32 
 
 
240 aa  270  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.3 
 
 
249 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  57.68 
 
 
244 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  54.81 
 
 
240 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.91 
 
 
247 aa  269  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  56.43 
 
 
242 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  55.78 
 
 
250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  54.36 
 
 
242 aa  269  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  54.58 
 
 
252 aa  268  4e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0204  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 
239 aa  268  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.701946  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  56.02 
 
 
254 aa  268  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  56.02 
 
 
242 aa  268  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  56.02 
 
 
254 aa  268  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.38 
 
 
240 aa  268  8e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  53.52 
 
 
263 aa  267  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 
240 aa  267  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  55.91 
 
 
254 aa  267  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  55.6 
 
 
255 aa  267  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  52.57 
 
 
254 aa  266  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  53.2 
 
 
263 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  56.61 
 
 
262 aa  266  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  54.07 
 
 
244 aa  266  2e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  52.7 
 
 
243 aa  266  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  53.15 
 
 
254 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.12 
 
 
267 aa  265  5e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  54.89 
 
 
252 aa  265  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  54.62 
 
 
273 aa  265  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  54.92 
 
 
250 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  55.19 
 
 
270 aa  265  7e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  56.43 
 
 
256 aa  265  7e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  55.24 
 
 
252 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  56.33 
 
 
248 aa  264  8e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  55.14 
 
 
256 aa  264  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  55.92 
 
 
250 aa  264  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1133  ABC transporter related  54.17 
 
 
243 aa  264  8.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.010872 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  55.6 
 
 
247 aa  264  8.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  54.36 
 
 
242 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  53.33 
 
 
256 aa  264  8.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  53.53 
 
 
247 aa  263  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  55.79 
 
 
257 aa  263  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  53.72 
 
 
248 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.63 
 
 
244 aa  263  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  53.56 
 
 
247 aa  263  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  53.91 
 
 
249 aa  263  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  59.03 
 
 
246 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 
273 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  56.2 
 
 
243 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.14 
 
 
240 aa  262  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  53.47 
 
 
256 aa  263  3e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  55.65 
 
 
269 aa  263  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.84 
 
 
246 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  54.69 
 
 
247 aa  262  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  55.42 
 
 
241 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  55.19 
 
 
251 aa  262  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  50 
 
 
246 aa  262  4e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  56.85 
 
 
251 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  53.11 
 
 
253 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  51.23 
 
 
248 aa  261  4.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.63 
 
 
244 aa  261  4.999999999999999e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  52.7 
 
 
242 aa  261  4.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.13 
 
 
246 aa  261  4.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>