More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2020 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  84.43 
 
 		 243 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  78.69 
 
 		 243 aa  401  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  75.82 
 
 		 248 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  72.13 
 
 		 243 aa  367  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  70.18 
 
 		 248 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  70.18 
 
 		 248 aa  324  7e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  65.16 
 
 		 248 aa  320  9.000000000000001e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  65.98 
 
 		 247 aa  318  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.57 
 
 		 240 aa  318  7e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  63.11 
 
 		 243 aa  315  6e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  63.93 
 
 		 249 aa  314  9e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  65.16 
 
 		 246 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  65.98 
 
 		 255 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  63.11 
 
 		 243 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  64.34 
 
 		 246 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  65.16 
 
 		 253 aa  311  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  64.49 
 
 		 244 aa  310  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.57 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.98 
 
 		 284 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  63.01 
 
 		 242 aa  308  6.999999999999999e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  63.67 
 
 		 245 aa  307  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  60.98 
 
 		 242 aa  306  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  62.2 
 
 		 244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  60.98 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  64.49 
 
 		 244 aa  305  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  61.48 
 
 		 243 aa  305  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  64.75 
 
 		 252 aa  305  3e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  64.08 
 
 		 244 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  60.25 
 
 		 242 aa  304  7e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  66.23 
 
 		 240 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  61.48 
 
 		 244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  61.63 
 
 		 245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  62.45 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  62.55 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  63.11 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3694  ABC transporter related  63.27 
 
 		 248 aa  302  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.749012  normal  0.245017 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  60.16 
 
 		 242 aa  301  9e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  63.11 
 
 		 246 aa  300  1e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  60.25 
 
 		 246 aa  300  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  62.7 
 
 		 242 aa  299  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.84 
 
 		 242 aa  299  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  62.3 
 
 		 239 aa  299  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  58.61 
 
 		 242 aa  298  5e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  59.35 
 
 		 242 aa  298  5e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  62.14 
 
 		 273 aa  298  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  59.43 
 
 		 240 aa  298  7e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5022  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.04 
 
 		 244 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.670825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  61.89 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  57.55 
 
 		 246 aa  296  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5072  ABC transporter related  62.04 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4896  ABC transporter related  62.04 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0657003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  59.84 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  60.25 
 
 		 242 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  61.48 
 
 		 246 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  60.66 
 
 		 240 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  60.91 
 
 		 273 aa  296  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  61.92 
 
 		 262 aa  295  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  60.25 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  62.45 
 
 		 244 aa  295  7e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  62.61 
 
 		 240 aa  294  9e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  60.66 
 
 		 255 aa  294  9e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  60.98 
 
 		 244 aa  294  9e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  59.26 
 
 		 250 aa  293  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.02 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  58.82 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  60.53 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  59.67 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  60 
 
 		 247 aa  292  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  63.18 
 
 		 247 aa  292  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  59.43 
 
 		 240 aa  291  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58.54 
 
 		 246 aa  291  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  60.82 
 
 		 246 aa  291  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  59.41 
 
 		 257 aa  291  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.59 
 
 		 256 aa  291  8e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  59.41 
 
 		 257 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  56.97 
 
 		 243 aa  291  8e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  62.7 
 
 		 242 aa  291  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  59.84 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  58.85 
 
 		 258 aa  290  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  58.85 
 
 		 258 aa  290  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  59.84 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  62.76 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  56.33 
 
 		 248 aa  290  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  61.07 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  58.78 
 
 		 268 aa  289  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  59.43 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  61.14 
 
 		 267 aa  289  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 251 aa  289  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  60.25 
 
 		 246 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  59.43 
 
 		 243 aa  288  4e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  59.41 
 
 		 259 aa  288  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  58.61 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  59.02 
 
 		 245 aa  288  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.37 
 
 		 244 aa  288  6e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  58.61 
 
 		 248 aa  287  8e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  58.02 
 
 		 269 aa  286  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  59.43 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.61 
 
 		 269 aa  287  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>