More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0249 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  100 
 
 		 261 aa  530  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  74.79 
 
 		 246 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  73.33 
 
 		 258 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  72.2 
 
 		 246 aa  358  6e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  70.54 
 
 		 247 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  72.54 
 
 		 243 aa  348  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  69.71 
 
 		 247 aa  346  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  69.71 
 
 		 247 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  69.14 
 
 		 249 aa  344  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  63.86 
 
 		 253 aa  329  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  63.86 
 
 		 253 aa  328  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  62.07 
 
 		 253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  62.25 
 
 		 258 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  62.55 
 
 		 249 aa  324  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  65.02 
 
 		 254 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  65.18 
 
 		 254 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  62.04 
 
 		 263 aa  323  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.73 
 
 		 252 aa  323  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  62.4 
 
 		 253 aa  323  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  62.14 
 
 		 249 aa  323  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.61 
 
 		 254 aa  322  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  63.97 
 
 		 253 aa  322  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.66 
 
 		 251 aa  322  4e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  64.37 
 
 		 254 aa  321  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.9 
 
 		 252 aa  321  7e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  61.73 
 
 		 249 aa  321  8e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.9 
 
 		 252 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.9 
 
 		 252 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  63.67 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  63.41 
 
 		 254 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  61.2 
 
 		 253 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  62.45 
 
 		 263 aa  319  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.01 
 
 		 254 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  63.01 
 
 		 254 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  63.01 
 
 		 254 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  63.49 
 
 		 252 aa  317  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  63.49 
 
 		 252 aa  317  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  59.92 
 
 		 267 aa  317  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.49 
 
 		 252 aa  317  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  63.49 
 
 		 252 aa  317  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  63.49 
 
 		 252 aa  317  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  62.66 
 
 		 242 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  59.39 
 
 		 265 aa  315  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  61.09 
 
 		 267 aa  315  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  61.2 
 
 		 255 aa  315  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  62.14 
 
 		 251 aa  315  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.57 
 
 		 269 aa  315  6e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  61.22 
 
 		 259 aa  315  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  59.92 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  59.68 
 
 		 259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  61.57 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  62.8 
 
 		 273 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  60.16 
 
 		 257 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  59.61 
 
 		 258 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  60.08 
 
 		 252 aa  311  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  62.4 
 
 		 273 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  62.81 
 
 		 244 aa  311  5.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 		 249 aa  311  6.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  60.16 
 
 		 257 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  59.76 
 
 		 269 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  60.56 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  61 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  60.48 
 
 		 255 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  62.5 
 
 		 251 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  59.07 
 
 		 268 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  62.98 
 
 		 250 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  62.7 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  63.49 
 
 		 244 aa  309  4e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  60.16 
 
 		 258 aa  308  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  60.16 
 
 		 258 aa  308  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  61.83 
 
 		 242 aa  308  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4002  ABC transporter related  63.6 
 
 		 253 aa  308  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.84 
 
 		 256 aa  308  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  59.76 
 
 		 257 aa  307  9e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  63.33 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  62.45 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  60.91 
 
 		 247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  63.98 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  61.63 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  62.24 
 
 		 247 aa  305  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  59.18 
 
 		 262 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  62.96 
 
 		 267 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  59.18 
 
 		 262 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  63.37 
 
 		 245 aa  306  3e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  62.75 
 
 		 252 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  62.66 
 
 		 247 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  63.49 
 
 		 241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  61.22 
 
 		 246 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  64.2 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  63.37 
 
 		 265 aa  304  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  58.78 
 
 		 262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  60.08 
 
 		 262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.51 
 
 		 252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  59.67 
 
 		 247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  60.98 
 
 		 248 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  59.84 
 
 		 248 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  63.67 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  60.17 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  59.75 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  59.75 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>