More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02497 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  100 
 
 
426 aa  883    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  80.85 
 
 
406 aa  666    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  76 
 
 
406 aa  647    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  72.25 
 
 
409 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  67.32 
 
 
414 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  66.11 
 
 
451 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  67.73 
 
 
414 aa  568  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  68.49 
 
 
413 aa  570  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  65.64 
 
 
441 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  66.83 
 
 
410 aa  566  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  66.59 
 
 
414 aa  566  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  66.11 
 
 
414 aa  559  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  64.78 
 
 
455 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  62 
 
 
412 aa  509  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  60.39 
 
 
436 aa  491  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  58.65 
 
 
415 aa  486  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  58.65 
 
 
411 aa  468  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  60.62 
 
 
418 aa  463  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  69.34 
 
 
506 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  44.74 
 
 
395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  44.64 
 
 
396 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  44.64 
 
 
396 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  44.39 
 
 
392 aa  298  9e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  39.26 
 
 
404 aa  290  3e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  37.88 
 
 
381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  40.26 
 
 
388 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  39.95 
 
 
394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  39.75 
 
 
401 aa  284  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  39.69 
 
 
394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  37.08 
 
 
381 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  39.27 
 
 
394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  38.71 
 
 
393 aa  272  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  38.79 
 
 
367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  38.83 
 
 
366 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  36.6 
 
 
413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  38.25 
 
 
375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  37.98 
 
 
375 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  36.6 
 
 
394 aa  262  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  37.17 
 
 
412 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  36.34 
 
 
394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  37.17 
 
 
412 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  36.07 
 
 
394 aa  259  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  38.11 
 
 
384 aa  258  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  34 
 
 
396 aa  257  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  36.07 
 
 
394 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  37.31 
 
 
376 aa  253  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  37.5 
 
 
393 aa  253  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  36.92 
 
 
380 aa  250  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  36.84 
 
 
373 aa  247  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  35.86 
 
 
391 aa  247  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  36.62 
 
 
379 aa  247  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  36.48 
 
 
373 aa  245  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  36.27 
 
 
377 aa  242  7e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  35.61 
 
 
382 aa  242  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  36.39 
 
 
380 aa  242  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  37.01 
 
 
372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  35.4 
 
 
380 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  36.29 
 
 
377 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  35.75 
 
 
380 aa  239  8e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  36.03 
 
 
377 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  36.01 
 
 
377 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  36.29 
 
 
377 aa  237  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  36.03 
 
 
377 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  36.03 
 
 
377 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  36.81 
 
 
371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  35.23 
 
 
378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  35.53 
 
 
369 aa  232  8.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  34.63 
 
 
378 aa  229  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.49 
 
 
377 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  33.51 
 
 
373 aa  227  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  32.81 
 
 
377 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  34.74 
 
 
375 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  34.44 
 
 
344 aa  217  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.7 
 
 
380 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.38 
 
 
389 aa  208  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  33.33 
 
 
370 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  32.38 
 
 
376 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  30.95 
 
 
381 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  29.09 
 
 
382 aa  189  7e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  30.81 
 
 
384 aa  186  7e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  28.57 
 
 
382 aa  186  8e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  31.43 
 
 
384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  30.98 
 
 
384 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  27.79 
 
 
382 aa  179  9e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  28.31 
 
 
382 aa  178  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  30.33 
 
 
410 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.19 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  29.95 
 
 
380 aa  167  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  29.86 
 
 
384 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  30.79 
 
 
384 aa  160  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  27.89 
 
 
387 aa  160  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  30.35 
 
 
312 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  30.13 
 
 
383 aa  157  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  30.53 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  30.33 
 
 
404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  27.44 
 
 
380 aa  153  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  28.35 
 
 
379 aa  153  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  28.07 
 
 
385 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  28.72 
 
 
414 aa  149  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  30.81 
 
 
376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>