More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0476 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0476  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  524  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.61284 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.34 
 
 		 253 aa  301  7.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.65 
 
 		 284 aa  297  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  58.92 
 
 		 244 aa  296  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  62.25 
 
 		 253 aa  296  3e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  64.05 
 
 		 252 aa  295  5e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  62.24 
 
 		 240 aa  295  5e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  63.49 
 
 		 239 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  62.24 
 
 		 243 aa  292  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  59.02 
 
 		 248 aa  291  9e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  61 
 
 		 240 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  61.41 
 
 		 243 aa  288  7e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  59.75 
 
 		 244 aa  285  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  58.44 
 
 		 244 aa  284  8e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  60.17 
 
 		 240 aa  284  9e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  62.24 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  58.09 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  60.08 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  59.34 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  58.57 
 
 		 263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  57.09 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  58.51 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  55.38 
 
 		 256 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.85 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  60.08 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  61.89 
 
 		 243 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  59.18 
 
 		 248 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  58.72 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  58.09 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  57.44 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  62.05 
 
 		 246 aa  278  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  56.57 
 
 		 252 aa  279  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  57.26 
 
 		 243 aa  278  5e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  56.63 
 
 		 255 aa  278  6e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  58.09 
 
 		 242 aa  278  6e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  57.26 
 
 		 243 aa  278  7e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  59.09 
 
 		 240 aa  278  8e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  57.26 
 
 		 243 aa  278  9e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.37 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  59.09 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  57.92 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  55.25 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  57.2 
 
 		 246 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  59.5 
 
 		 246 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  56.85 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  57.55 
 
 		 247 aa  275  5e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.68 
 
 		 244 aa  275  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3694  ABC transporter related  57.26 
 
 		 248 aa  275  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.749012  normal  0.245017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  58.54 
 
 		 251 aa  275  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  55.98 
 
 		 256 aa  275  7e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  58.54 
 
 		 248 aa  274  9e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  57.79 
 
 		 257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60.44 
 
 		 249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  59.56 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  57.26 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  56.68 
 
 		 261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  62.22 
 
 		 248 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  62.22 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  60.98 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  55.6 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  58.54 
 
 		 252 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  57.26 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  55.81 
 
 		 262 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  56.8 
 
 		 257 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  57.68 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 		 270 aa  272  4.0000000000000004e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  55.65 
 
 		 251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  58.61 
 
 		 248 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  60.49 
 
 		 243 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  60.35 
 
 		 243 aa  271  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  57.44 
 
 		 246 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  53.15 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  55.83 
 
 		 263 aa  270  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  54.47 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  56.02 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  57.26 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  54.47 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  58.33 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  56.73 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  56.43 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  52.12 
 
 		 259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 262 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  60.08 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  56.02 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  56.85 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1427  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.37 
 
 		 254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.798316  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  55.97 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  56.97 
 
 		 264 aa  269  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  54.58 
 
 		 258 aa  268  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  57.68 
 
 		 242 aa  268  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  56.2 
 
 		 246 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  54.77 
 
 		 242 aa  268  7e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  56.73 
 
 		 249 aa  268  8e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  54.4 
 
 		 254 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  54.4 
 
 		 254 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.6 
 
 		 244 aa  268  8.999999999999999e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  59.18 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  56.43 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>