More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1551 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  100 
 
 
264 aa  531  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  75.86 
 
 
261 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  78.54 
 
 
257 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  79.59 
 
 
262 aa  398  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  77.37 
 
 
259 aa  396  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  78.19 
 
 
247 aa  390  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  76.54 
 
 
251 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  76.73 
 
 
258 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  77.14 
 
 
251 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  77.6 
 
 
257 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  77.14 
 
 
251 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  77.69 
 
 
249 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  76.54 
 
 
251 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  76.64 
 
 
248 aa  384  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  76.54 
 
 
247 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  73.25 
 
 
270 aa  382  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  74.07 
 
 
256 aa  380  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  76.54 
 
 
244 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  75.31 
 
 
251 aa  378  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  71.31 
 
 
256 aa  374  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  74.07 
 
 
254 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  73.36 
 
 
255 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  74.07 
 
 
254 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  71.54 
 
 
252 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  73.97 
 
 
242 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  70.66 
 
 
242 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  73.66 
 
 
250 aa  364  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  76.13 
 
 
280 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  72 
 
 
274 aa  366  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  76.13 
 
 
264 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.75 
 
 
264 aa  360  1e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  73.14 
 
 
242 aa  359  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  71.19 
 
 
244 aa  351  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  68.72 
 
 
244 aa  336  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.07 
 
 
252 aa  322  5e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  61.57 
 
 
242 aa  317  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  61.32 
 
 
255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  60.58 
 
 
258 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  61 
 
 
246 aa  310  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  60.91 
 
 
252 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  60.49 
 
 
253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  63.07 
 
 
246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  61.16 
 
 
242 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  61.98 
 
 
249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  63.79 
 
 
243 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  59.53 
 
 
261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  61.67 
 
 
246 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  59.34 
 
 
263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  63.6 
 
 
249 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  61.57 
 
 
248 aa  305  3e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  62.66 
 
 
244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.63 
 
 
253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1547  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.17 
 
 
241 aa  305  7e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  60.33 
 
 
242 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0834  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  63.79 
 
 
249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  62.96 
 
 
243 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.4 
 
 
284 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  58.61 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  60.41 
 
 
247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  62.14 
 
 
243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  60.49 
 
 
252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  58.61 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  63.18 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  60.74 
 
 
241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  58.51 
 
 
262 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  62.4 
 
 
252 aa  303  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  59.43 
 
 
259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2136  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.17 
 
 
241 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68203  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.17 
 
 
241 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0775  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.17 
 
 
241 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.17 
 
 
241 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2609  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.17 
 
 
241 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  58.92 
 
 
263 aa  301  7.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  58.26 
 
 
253 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  61.92 
 
 
273 aa  301  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  59.58 
 
 
253 aa  300  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  59.58 
 
 
253 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  59.51 
 
 
255 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  61.16 
 
 
253 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  61.32 
 
 
246 aa  299  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  59.34 
 
 
259 aa  299  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  59.59 
 
 
247 aa  298  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4250  ABC transporter related  65.02 
 
 
257 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682054  normal  0.0122802 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  58.2 
 
 
257 aa  299  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  56.1 
 
 
246 aa  298  5e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  61.92 
 
 
249 aa  298  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  59.17 
 
 
253 aa  298  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  59.58 
 
 
242 aa  298  6e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  59.44 
 
 
254 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  61.92 
 
 
249 aa  298  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  57.44 
 
 
248 aa  298  7e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  61.67 
 
 
242 aa  298  7e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  57.77 
 
 
254 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  59.17 
 
 
253 aa  298  8e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  58.78 
 
 
252 aa  298  8e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.68 
 
 
240 aa  297  9e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  58.23 
 
 
253 aa  297  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  61.11 
 
 
258 aa  297  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.37 
 
 
254 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  58.26 
 
 
249 aa  296  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>