More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2910 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2910  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  490  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  63.01 
 
 
250 aa  314  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  62.6 
 
 
252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.79 
 
 
250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  62.6 
 
 
252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  62.6 
 
 
252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  62.6 
 
 
250 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.38 
 
 
250 aa  301  5.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  62.2 
 
 
250 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.38 
 
 
250 aa  300  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.38 
 
 
250 aa  300  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.38 
 
 
250 aa  300  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  61.38 
 
 
250 aa  300  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  62.2 
 
 
250 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.38 
 
 
250 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  62.2 
 
 
250 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  62.2 
 
 
250 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.38 
 
 
250 aa  298  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.16 
 
 
253 aa  298  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.16 
 
 
253 aa  298  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.83 
 
 
252 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2033  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.76 
 
 
253 aa  294  8e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  62.55 
 
 
249 aa  289  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  60.49 
 
 
251 aa  288  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.49 
 
 
247 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  57.56 
 
 
243 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  57.98 
 
 
243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  58.92 
 
 
248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  58.61 
 
 
248 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.26 
 
 
247 aa  278  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  57.98 
 
 
253 aa  276  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  57.98 
 
 
252 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  58.92 
 
 
248 aa  272  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  60.17 
 
 
251 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  57.14 
 
 
240 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  56.02 
 
 
244 aa  270  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  53.78 
 
 
255 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  56.72 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.32 
 
 
244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  57.56 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  56.33 
 
 
253 aa  268  4e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  58.16 
 
 
243 aa  267  8.999999999999999e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0791  ABC transporter related protein  57.74 
 
 
251 aa  267  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 
244 aa  267  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  55.56 
 
 
254 aa  266  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  57.85 
 
 
253 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 
244 aa  266  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  56.3 
 
 
243 aa  266  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 
244 aa  265  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 
244 aa  265  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  55.6 
 
 
255 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 
244 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  55.69 
 
 
271 aa  265  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  53.6 
 
 
253 aa  265  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1778  ABC transporter related  52.03 
 
 
271 aa  265  5.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 
244 aa  265  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 
244 aa  264  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  55.6 
 
 
267 aa  263  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4025  ABC transporter related  60.61 
 
 
251 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4341  ABC transporter related  60.61 
 
 
251 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  57.87 
 
 
243 aa  262  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  55.24 
 
 
260 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  54.62 
 
 
240 aa  261  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  54.58 
 
 
244 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  54.62 
 
 
240 aa  261  8.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 
244 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 
244 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  55.56 
 
 
258 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  58.44 
 
 
243 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.54 
 
 
273 aa  259  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  54.92 
 
 
260 aa  259  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1918  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  51.25 
 
 
255 aa  259  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.248915  hitchhiker  0.0037294 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5324  ABC transporter related  55.97 
 
 
254 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.836598  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  54.8 
 
 
255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4943  ABC transporter related  55.97 
 
 
254 aa  258  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5031  ABC transporter related  55.97 
 
 
254 aa  258  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  53.44 
 
 
259 aa  258  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.04 
 
 
240 aa  258  7e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  56.73 
 
 
245 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.97 
 
 
278 aa  258  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  56.73 
 
 
245 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.94 
 
 
254 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 
241 aa  257  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  54.2 
 
 
240 aa  257  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  53.23 
 
 
267 aa  257  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2602  ABC transporter related  53.39 
 
 
248 aa  257  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  53.78 
 
 
241 aa  257  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  52.1 
 
 
240 aa  257  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  53.78 
 
 
241 aa  257  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  54.03 
 
 
260 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.2 
 
 
240 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.2 
 
 
240 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  55 
 
 
244 aa  256  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  53.78 
 
 
241 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  56.71 
 
 
243 aa  256  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  55.04 
 
 
239 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  54.2 
 
 
240 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 
240 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 
240 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  52.82 
 
 
263 aa  255  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>