More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1012 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1012  ABC transporter-related protein  100 
 
 
264 aa  532  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0745  ABC transporter related  76.06 
 
 
260 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  76.8 
 
 
255 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0713  ABC transporter related  76.06 
 
 
260 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  74.44 
 
 
267 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2971  ABC transporter related  72.11 
 
 
254 aa  368  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  68.68 
 
 
269 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  67.47 
 
 
254 aa  341  8e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  60.4 
 
 
255 aa  311  6.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  58.73 
 
 
263 aa  293  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  58.4 
 
 
250 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  58.17 
 
 
254 aa  292  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  56.4 
 
 
242 aa  291  5e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  56.4 
 
 
256 aa  291  9e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  58 
 
 
250 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  54.8 
 
 
240 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58 
 
 
252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.4 
 
 
240 aa  288  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 
240 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  54.4 
 
 
242 aa  286  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.77 
 
 
252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.43 
 
 
267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.77 
 
 
252 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.77 
 
 
252 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  58 
 
 
251 aa  285  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59.2 
 
 
244 aa  284  8e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 
240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 
240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  54.14 
 
 
273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.94 
 
 
247 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.4 
 
 
240 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  58.3 
 
 
244 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  53.26 
 
 
260 aa  281  9e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.6 
 
 
240 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  54.8 
 
 
240 aa  281  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  54.58 
 
 
256 aa  280  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 
260 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  54.17 
 
 
264 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  53.94 
 
 
260 aa  279  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  57.6 
 
 
240 aa  279  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.4 
 
 
240 aa  279  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  54.55 
 
 
259 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  54 
 
 
240 aa  278  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  55.51 
 
 
246 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  56.18 
 
 
246 aa  278  7e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.42 
 
 
250 aa  278  9e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  57.09 
 
 
243 aa  277  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  55.2 
 
 
241 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  55.2 
 
 
241 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  56.8 
 
 
240 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.32 
 
 
247 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.42 
 
 
592 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  54 
 
 
242 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  56.4 
 
 
239 aa  276  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  53.2 
 
 
240 aa  276  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  56.18 
 
 
254 aa  276  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  54.4 
 
 
240 aa  276  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  57.6 
 
 
240 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  53.52 
 
 
252 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  55.12 
 
 
246 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  56.4 
 
 
240 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.4 
 
 
241 aa  275  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  54.8 
 
 
241 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  54.4 
 
 
241 aa  275  5e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  54.4 
 
 
241 aa  275  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  53.33 
 
 
255 aa  275  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  55.2 
 
 
241 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  55.77 
 
 
257 aa  275  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  52.78 
 
 
242 aa  275  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  52.78 
 
 
242 aa  275  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  57.2 
 
 
240 aa  275  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  56.3 
 
 
244 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.98 
 
 
240 aa  275  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  54.55 
 
 
247 aa  275  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  55.6 
 
 
242 aa  275  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.98 
 
 
240 aa  275  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52 
 
 
240 aa  275  8e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0257  ATP-binding protein  53.6 
 
 
248 aa  274  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000197314 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0210  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 
248 aa  274  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.770881  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  52.87 
 
 
253 aa  275  8e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.13 
 
 
249 aa  274  9e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  56.4 
 
 
240 aa  274  9e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  56.3 
 
 
244 aa  274  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  54.4 
 
 
241 aa  274  9e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 
240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  56.64 
 
 
266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  54.98 
 
 
240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  54.98 
 
 
240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  55.38 
 
 
240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  52.36 
 
 
259 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  54.8 
 
 
259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.98 
 
 
240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  55.2 
 
 
244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.6 
 
 
240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  55 
 
 
252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>