More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0412 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0412  ABC transporter foramino acid ATP-binding protein  100 
 
 		 259 aa  535  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.123929  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.68 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  53.75 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  54.22 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.87 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  52.78 
 
 		 254 aa  278  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  55.06 
 
 		 299 aa  278  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  53.41 
 
 		 258 aa  278  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.68 
 
 		 242 aa  278  9e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.1 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.1 
 
 		 240 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  56.91 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.69 
 
 		 246 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  56.1 
 
 		 242 aa  276  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.69 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.69 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  55.69 
 
 		 240 aa  275  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  54.66 
 
 		 268 aa  275  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  55.87 
 
 		 240 aa  275  6e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  54.18 
 
 		 244 aa  275  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  55.69 
 
 		 240 aa  275  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  55.69 
 
 		 240 aa  275  8e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.69 
 
 		 240 aa  275  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.06 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  55.47 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.68 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  53.04 
 
 		 246 aa  272  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  54.66 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  54.33 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  54.58 
 
 		 244 aa  272  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  56.68 
 
 		 240 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  54.88 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  53.44 
 
 		 240 aa  271  9e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 		 240 aa  271  9e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0345  ABC transporter-related protein  54.88 
 
 		 240 aa  271  9e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.1 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.1 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 		 282 aa  270  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.1 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  55.87 
 
 		 239 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.1 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.1 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.1 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  50 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  54.88 
 
 		 263 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  50 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.69 
 
 		 240 aa  269  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  52.19 
 
 		 244 aa  268  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  52.59 
 
 		 247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  53.04 
 
 		 268 aa  268  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  54.44 
 
 		 253 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  55.02 
 
 		 243 aa  268  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.85 
 
 		 245 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.61 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  52.19 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.98 
 
 		 300 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  52.85 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  54.66 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  53.04 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  49.61 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  54.66 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  51.59 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  53.25 
 
 		 288 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  53.25 
 
 		 360 aa  266  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  52.21 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  54.25 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  52.23 
 
 		 259 aa  265  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  53.56 
 
 		 260 aa  265  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  49.61 
 
 		 257 aa  265  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  55.28 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  52.59 
 
 		 242 aa  265  5e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  53.23 
 
 		 254 aa  265  7e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2781  ABC transporter related  48.82 
 
 		 256 aa  265  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  53.25 
 
 		 363 aa  265  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  52.8 
 
 		 249 aa  264  8e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  51.01 
 
 		 267 aa  265  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  52.23 
 
 		 252 aa  263  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  51.61 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  52.23 
 
 		 243 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  53.04 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  51.01 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  51.42 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  53.78 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.43 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  53.44 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  53.25 
 
 		 363 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  50.2 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  54.66 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  49.21 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  51.82 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  51.82 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  53.6 
 
 		 243 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  52.23 
 
 		 241 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  52.63 
 
 		 241 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  51.79 
 
 		 252 aa  263  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>