More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4842 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4842  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  540  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463147  normal  0.18459 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4287  ABC transporter related  99.25 
 
 		 265 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6799  ABC transporter related  98.11 
 
 		 265 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.557054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2789  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  65.76 
 
 		 264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.782335  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2452  ABC transporter related  66.27 
 
 		 259 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0182129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2730  ABC-type histidine transport system, ATPase component  65.76 
 
 		 264 aa  338  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2317  ABC transporter related  66.27 
 
 		 259 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.687012 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0887  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.53 
 
 		 255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1087  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  66.27 
 
 		 255 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1245  histidine transport ATP-binding protein  66.27 
 
 		 255 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1092  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  66.27 
 
 		 255 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195395  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1582  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.27 
 
 		 255 aa  335  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0189341  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1059  ABC transporter related  66.01 
 
 		 266 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0744  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.27 
 
 		 255 aa  335  5e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0985  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.27 
 
 		 255 aa  335  5e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3015  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.27 
 
 		 255 aa  335  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0526452  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1056  ABC transporter related  66.01 
 
 		 266 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5734  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  65.46 
 
 		 259 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.791565  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0589  arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  65.37 
 
 		 264 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2851  histidine transport ATP-binding protein  65.37 
 
 		 264 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2429  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  65.37 
 
 		 264 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1739  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  65.37 
 
 		 264 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2862  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  65.37 
 
 		 264 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  64.2 
 
 		 263 aa  333  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  66.8 
 
 		 263 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  66.14 
 
 		 259 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  66.14 
 
 		 259 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  66.8 
 
 		 263 aa  332  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.37 
 
 		 264 aa  332  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2649  ABC transporter related  64.31 
 
 		 260 aa  332  4e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  65.22 
 
 		 264 aa  332  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  65.74 
 
 		 259 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  62.95 
 
 		 268 aa  330  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  64.4 
 
 		 258 aa  329  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1259  ABC transporter related  64.96 
 
 		 260 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1155  ABC transporter related  64.82 
 
 		 266 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  65.06 
 
 		 259 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1556  ABC transporter related  63.04 
 
 		 263 aa  328  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4289  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  64.43 
 
 		 266 aa  328  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0698  ABC transporter related  64.43 
 
 		 274 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26151  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1120  ABC transporter related  63.05 
 
 		 259 aa  328  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1177  ABC transporter related  64.43 
 
 		 274 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  62.65 
 
 		 259 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2166  ABC transporter related  61.85 
 
 		 261 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000000402922  hitchhiker  0.000000271628 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5748  ABC transporter related  67.2 
 
 		 263 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6594  ABC transporter related  67.2 
 
 		 263 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147367 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6112  ABC transporter related  67.2 
 
 		 263 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  63.05 
 
 		 264 aa  323  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2925  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, ATPase subunit  63.04 
 
 		 275 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628075  normal  0.276271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  62.7 
 
 		 255 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  61.6 
 
 		 254 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  61.6 
 
 		 254 aa  319  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5103  ABC transporter related  66 
 
 		 263 aa  319  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351754  hitchhiker  0.00435493 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5620  ABC transporter related  66.4 
 
 		 263 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33769  normal  0.48153 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5837  ABC transporter related  66.4 
 
 		 263 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7501  ABC transporter related  62.25 
 
 		 273 aa  315  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  61.29 
 
 		 256 aa  315  6e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  61.66 
 
 		 257 aa  314  7e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  62.06 
 
 		 257 aa  314  8e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 		 257 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0338  ABC transporter related  61.54 
 
 		 285 aa  312  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 		 257 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  61.26 
 
 		 260 aa  310  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1957  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, ATP-binding component  64.54 
 
 		 256 aa  310  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003973  arginine/ornithine ABC transporter ATP-binding protein AotP  64.54 
 
 		 256 aa  309  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52750  arginine/ornithine transport protein AotP  64.92 
 
 		 254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01549  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.94 
 
 		 256 aa  309  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2883  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  62.55 
 
 		 257 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4622  arginine/ornithine transport protein AotP  64.92 
 
 		 254 aa  308  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2781  ABC transporter related  60.4 
 
 		 256 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2558  ABC transporter related  64.17 
 
 		 260 aa  308  8e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411241  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.47 
 
 		 257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2913  ABC transporter related  63.71 
 
 		 254 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.289619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3772  ABC transporter related  64.11 
 
 		 254 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446959  hitchhiker  0.00629002 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4530  ABC transporter related  66.8 
 
 		 259 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0252344  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1521  ABC transporter related  65.73 
 
 		 258 aa  305  7e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.24 
 
 		 254 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4288  ABC transporter-like  63.31 
 
 		 254 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1455  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.55 
 
 		 256 aa  304  9.000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0011921  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4483  basic amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.71 
 
 		 254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1432  ABC transporter related  63.71 
 
 		 254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172857  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3988  ABC transporter related  63.31 
 
 		 254 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1830  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  62.8 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3878  ABC transporter  60.24 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999854  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1090  ABC transporter related  64.37 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455467  normal  0.0958562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0283  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 		 257 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  hitchhiker  0.000143941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4911  ABC transporter  60.08 
 
 		 257 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6396  ABC transporter related  65.99 
 
 		 259 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784056  normal  0.338935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4927  ABC transporter related  59.68 
 
 		 257 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000746315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0306  ABC transporter related  60.08 
 
 		 257 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0328197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0301  ABC transporter related  59.68 
 
 		 257 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal  0.0971272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3567  ABC transporter  62 
 
 		 254 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2580  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  60.71 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.676694  normal  0.169811 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2701  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  60.71 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2492  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  60.71 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.793796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1206  ABC transporter-like  59.44 
 
 		 254 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2592  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  60.71 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2538  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  60.71 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2375  ABC transporter, ATPase subunit  60.84 
 
 		 266 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  59.2 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>