More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3083 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3083  glutamine/glutamate ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 253 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  97.23 
 
 		 253 aa  506  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  77.82 
 
 		 265 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5219  ABC transporter related  74 
 
 		 257 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.95 
 
 		 255 aa  357  7e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  68.95 
 
 		 255 aa  357  9e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  64.92 
 
 		 256 aa  340  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  63.49 
 
 		 259 aa  323  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0663  SMR family multidrug efflux pump  60.33 
 
 		 245 aa  314  8e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0289  general L-amino acid transport ATP-binding protein AapP  59.75 
 
 		 245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0519  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.5 
 
 		 245 aa  312  3.9999999999999997e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0494  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.09 
 
 		 245 aa  309  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000537818  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1470  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.68 
 
 		 245 aa  308  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000837617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  62.56 
 
 		 251 aa  305  6e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0692  conserved hypothetical protein, ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family (ATP-binding protein)  59.5 
 
 		 245 aa  301  9e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.611773  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.85 
 
 		 252 aa  300  1e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 242 aa  285  5.999999999999999e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  54.47 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.68 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  54.73 
 
 		 244 aa  275  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  55.24 
 
 		 299 aa  272  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.78 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  54.58 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.78 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0121  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.44 
 
 		 246 aa  271  6e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  53.97 
 
 		 256 aa  271  9e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  57.14 
 
 		 244 aa  271  9e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  54.17 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.05 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  56.3 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  56.6 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  55.7 
 
 		 259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  55.51 
 
 		 240 aa  269  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  55.93 
 
 		 240 aa  268  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  55.93 
 
 		 240 aa  268  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  54.24 
 
 		 249 aa  269  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.93 
 
 		 240 aa  268  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  52.46 
 
 		 248 aa  268  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  54.81 
 
 		 242 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  52.94 
 
 		 240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.17 
 
 		 240 aa  268  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  54.81 
 
 		 242 aa  268  7e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 242 aa  268  7e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  54.39 
 
 		 251 aa  268  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.51 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.51 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  56.96 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  52.7 
 
 		 261 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.13 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  52.82 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  55.51 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  56.25 
 
 		 257 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  55.93 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  53.81 
 
 		 249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.1 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.97 
 
 		 249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  56.07 
 
 		 246 aa  265  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  52.94 
 
 		 263 aa  265  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  56.17 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  53.5 
 
 		 262 aa  265  5.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  52.08 
 
 		 253 aa  265  7e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  53.97 
 
 		 262 aa  265  7e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  55.19 
 
 		 267 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  54.81 
 
 		 249 aa  265  8e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1234  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.68 
 
 		 240 aa  264  8e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  53.94 
 
 		 247 aa  265  8e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.08 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  52.1 
 
 		 263 aa  264  8.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  54.81 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  53.94 
 
 		 244 aa  264  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  54.2 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  54.58 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  54.58 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  55 
 
 		 242 aa  263  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.08 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  54.62 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  56.61 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>