More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1540 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 		 252 aa  508  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  59.67 
 
 		 259 aa  322  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.41 
 
 		 255 aa  319  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  60.41 
 
 		 255 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0494  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 245 aa  311  4.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000537818  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0289  general L-amino acid transport ATP-binding protein AapP  58.37 
 
 		 245 aa  311  5.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1470  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 245 aa  311  5.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000837617  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0519  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 245 aa  311  6.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0692  conserved hypothetical protein, ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family (ATP-binding protein)  61.07 
 
 		 245 aa  311  7.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.611773  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  59.43 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0663  SMR family multidrug efflux pump  58.37 
 
 		 245 aa  308  5e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  57.96 
 
 		 256 aa  305  3e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  59.09 
 
 		 265 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  58.68 
 
 		 253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3083  glutamine/glutamate ABC transporter, ATP-binding protein  57.85 
 
 		 253 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262111  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0447  ABC transporter related  55.6 
 
 		 251 aa  288  7e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5219  ABC transporter related  57.85 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  56.3 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.01 
 
 		 244 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  54.62 
 
 		 244 aa  271  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  52.52 
 
 		 249 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  58.05 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  54.17 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  54.17 
 
 		 242 aa  269  4e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  53.59 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0121  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  49.19 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.11 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  51.85 
 
 		 244 aa  265  4e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  52.32 
 
 		 244 aa  265  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  51.27 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  54.01 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  51.27 
 
 		 243 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.74 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  48.64 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  54.43 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0093  amino acid ABC transporter ATPase  53.97 
 
 		 263 aa  263  3e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  49.37 
 
 		 240 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  54.43 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  51.48 
 
 		 240 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  52.74 
 
 		 249 aa  261  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  53.59 
 
 		 241 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  50.85 
 
 		 240 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  48.95 
 
 		 240 aa  261  8e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  52.12 
 
 		 246 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  51.05 
 
 		 243 aa  261  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  48.1 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  51.45 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  51.88 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.12 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  52.12 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  51.05 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  53.78 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  52.12 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  50.42 
 
 		 247 aa  259  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.12 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  49.16 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.12 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.12 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  50.85 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.04 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  51.05 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.32 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.12 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.12 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.12 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  52.52 
 
 		 244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  50.42 
 
 		 243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  50.2 
 
 		 256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  50.63 
 
 		 251 aa  258  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 284 aa  258  6e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.63 
 
 		 253 aa  258  7e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.52 
 
 		 244 aa  258  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 242 aa  258  7e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  52.32 
 
 		 241 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  52.32 
 
 		 241 aa  258  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  50.83 
 
 		 245 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  51.27 
 
 		 249 aa  258  9e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  50.83 
 
 		 249 aa  258  9e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  50.63 
 
 		 240 aa  258  9e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.69 
 
 		 240 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  48.74 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  51.27 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  49.79 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  52.32 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>