More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4583 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  531  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  67.49 
 
 
256 aa  353  1e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.73 
 
 
255 aa  345  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  64.73 
 
 
255 aa  344  8e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0692  conserved hypothetical protein, ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family (ATP-binding protein)  63.9 
 
 
245 aa  336  1.9999999999999998e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.611773  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  65.15 
 
 
265 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0519  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 
245 aa  330  2e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0494  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 
245 aa  330  2e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000537818  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1470  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61 
 
 
245 aa  328  7e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000837617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3083  glutamine/glutamate ABC transporter, ATP-binding protein  63.49 
 
 
253 aa  323  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262111  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0663  SMR family multidrug efflux pump  60.49 
 
 
245 aa  323  2e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.67 
 
 
252 aa  322  3e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0289  general L-amino acid transport ATP-binding protein AapP  60.49 
 
 
245 aa  322  4e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  63.07 
 
 
253 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  60.98 
 
 
251 aa  316  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5219  ABC transporter related  63.9 
 
 
257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  54.24 
 
 
242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  53.54 
 
 
252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  57.89 
 
 
259 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  53.59 
 
 
240 aa  278  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0447  ABC transporter related  56.15 
 
 
251 aa  278  7e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  55.7 
 
 
242 aa  277  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  52.07 
 
 
241 aa  277  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  53.97 
 
 
242 aa  276  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0121  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.65 
 
 
246 aa  276  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  54.01 
 
 
240 aa  276  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  53.11 
 
 
248 aa  275  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.74 
 
 
240 aa  275  7e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  53.11 
 
 
248 aa  275  7e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  54.43 
 
 
240 aa  274  8e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  52.54 
 
 
240 aa  274  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  51.9 
 
 
242 aa  274  9e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  53.56 
 
 
242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  54.43 
 
 
241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.54 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.54 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.54 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  53.31 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  52.4 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.54 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.54 
 
 
240 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  54.62 
 
 
256 aa  273  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  54.43 
 
 
243 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  54.24 
 
 
249 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  54.2 
 
 
244 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  53.81 
 
 
252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  53.09 
 
 
253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  54.01 
 
 
241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  52.32 
 
 
240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  52.54 
 
 
242 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.12 
 
 
240 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  54.01 
 
 
240 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.7 
 
 
257 aa  271  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.12 
 
 
240 aa  271  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  52.67 
 
 
249 aa  271  6e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  53.5 
 
 
246 aa  271  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  55.93 
 
 
255 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  52.05 
 
 
253 aa  271  9e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  52.07 
 
 
249 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  53.16 
 
 
242 aa  270  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  54.01 
 
 
240 aa  270  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  54.24 
 
 
242 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  53.16 
 
 
244 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  54.24 
 
 
242 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  53.39 
 
 
244 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 
251 aa  270  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  54.77 
 
 
260 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0093  amino acid ABC transporter ATPase  54.4 
 
 
263 aa  270  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.59 
 
 
242 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  53.97 
 
 
243 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.32 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  52.07 
 
 
249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  53.78 
 
 
251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  51.88 
 
 
247 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.77 
 
 
260 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  53.72 
 
 
244 aa  269  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.74 
 
 
284 aa  269  4e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  53.2 
 
 
260 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.8 
 
 
269 aa  268  5.9999999999999995e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  49.8 
 
 
260 aa  268  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  53.97 
 
 
251 aa  268  8.999999999999999e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  54.42 
 
 
243 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  51.9 
 
 
240 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 
240 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  51.27 
 
 
243 aa  267  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 
240 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  52.59 
 
 
257 aa  267  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  51.69 
 
 
240 aa  267  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  53.16 
 
 
241 aa  267  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  52.1 
 
 
244 aa  267  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  53.97 
 
 
258 aa  267  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  53.16 
 
 
241 aa  267  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.08 
 
 
240 aa  266  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 
251 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  51.05 
 
 
240 aa  266  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  52.05 
 
 
254 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.08 
 
 
240 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  53.53 
 
 
246 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>