More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5219 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5219  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  84.27 
 
 		 265 aa  430  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  74.4 
 
 		 253 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3083  glutamine/glutamate ABC transporter, ATP-binding protein  74 
 
 		 253 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.97 
 
 		 255 aa  345  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  64.37 
 
 		 255 aa  345  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0663  SMR family multidrug efflux pump  64.32 
 
 		 245 aa  343  1e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0289  general L-amino acid transport ATP-binding protein AapP  61.83 
 
 		 245 aa  332  4e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  63.9 
 
 		 259 aa  329  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  58.7 
 
 		 256 aa  328  8e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1470  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.68 
 
 		 245 aa  321  6e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000837617  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0494  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.26 
 
 		 245 aa  321  9.000000000000001e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000537818  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0519  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.85 
 
 		 245 aa  318  3.9999999999999996e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0692  conserved hypothetical protein, ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family (ATP-binding protein)  59.5 
 
 		 245 aa  318  3.9999999999999996e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.611773  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.85 
 
 		 252 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  60.62 
 
 		 251 aa  291  8e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0121  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.1 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  52.72 
 
 		 240 aa  285  7e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  56.9 
 
 		 242 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 		 240 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.3 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.3 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  52.52 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  54.2 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  54.96 
 
 		 243 aa  279  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  59.17 
 
 		 246 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.88 
 
 		 240 aa  279  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  53.53 
 
 		 244 aa  278  6e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.88 
 
 		 240 aa  277  9e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.68 
 
 		 240 aa  277  9e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.19 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  54.77 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  56.3 
 
 		 244 aa  276  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  53.97 
 
 		 262 aa  276  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.19 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  55.7 
 
 		 249 aa  274  9e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  56.67 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  56.3 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  54.2 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  53.53 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  53.97 
 
 		 246 aa  272  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  55.65 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  56.07 
 
 		 248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  52.72 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  53.53 
 
 		 261 aa  271  5.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  55.6 
 
 		 247 aa  271  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  52.32 
 
 		 240 aa  271  6e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  52.72 
 
 		 246 aa  271  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  51.05 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  52.7 
 
 		 255 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  51.26 
 
 		 242 aa  270  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  53.33 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  53.33 
 
 		 242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  52.3 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  55.65 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  51.69 
 
 		 249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  53.72 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  53.11 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  53.97 
 
 		 242 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  53.36 
 
 		 244 aa  269  4e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  51.05 
 
 		 249 aa  269  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  54.66 
 
 		 247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  52.72 
 
 		 246 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  54.89 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  57.32 
 
 		 261 aa  268  8e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  52.32 
 
 		 259 aa  268  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  54.2 
 
 		 244 aa  268  8.999999999999999e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  57.14 
 
 		 252 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  55.84 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  51.9 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  52.3 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  53.78 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  52.7 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  54.39 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  51.84 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  51.67 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  53.14 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  51.88 
 
 		 240 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  52.5 
 
 		 244 aa  267  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.81 
 
 		 240 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  53.56 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  52.12 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 245 aa  265  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  51.26 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  51.27 
 
 		 249 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 242 aa  265  4e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  52.02 
 
 		 252 aa  265  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  51.88 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  53.11 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  52.72 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  53.56 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  51.05 
 
 		 242 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  51.68 
 
 		 240 aa  265  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  52.92 
 
 		 249 aa  265  7e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0528  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50.21 
 
 		 258 aa  265  7e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191469  normal  0.015863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 		 240 aa  264  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>