More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0121 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0121  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  55.69 
 
 		 256 aa  294  9e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0663  SMR family multidrug efflux pump  54.47 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0289  general L-amino acid transport ATP-binding protein AapP  54.47 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.11 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  52.28 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  52.26 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  55.65 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  51.03 
 
 		 265 aa  275  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0494  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.1 
 
 		 245 aa  273  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000537818  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0519  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.1 
 
 		 245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0692  conserved hypothetical protein, ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family (ATP-binding protein)  52.26 
 
 		 245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.611773  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5219  ABC transporter related  54.1 
 
 		 257 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3083  glutamine/glutamate ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 		 253 aa  271  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262111  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1470  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.26 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000837617  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  49.19 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  49.37 
 
 		 248 aa  258  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 262 aa  259  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  51.84 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0447  ABC transporter related  50.2 
 
 		 251 aa  254  7e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0093  amino acid ABC transporter ATPase  51.25 
 
 		 263 aa  248  8e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  47.08 
 
 		 252 aa  248  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  48.1 
 
 		 243 aa  248  9e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1234  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  49.79 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0595  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.52 
 
 		 259 aa  247  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.062853  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  45.71 
 
 		 246 aa  245  4e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  50.63 
 
 		 246 aa  245  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  47.26 
 
 		 270 aa  245  6e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0850  ATPase  46.89 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.736744  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  48.13 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  47.92 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  46.69 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  46.69 
 
 		 244 aa  242  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  48.74 
 
 		 242 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  48.12 
 
 		 242 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  48.52 
 
 		 240 aa  241  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12101  ABC transporter for amino acids, ATP binding component  46.64 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  46.41 
 
 		 256 aa  241  9e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  47.7 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  46.44 
 
 		 256 aa  240  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  47.7 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  49.37 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  46.5 
 
 		 246 aa  239  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0834  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  47.33 
 
 		 249 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.84 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  46.31 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  45.57 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1806  ATPase  45.64 
 
 		 247 aa  239  4e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  45.04 
 
 		 245 aa  238  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.87 
 
 		 264 aa  238  5e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0528  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.9 
 
 		 258 aa  238  5e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191469  normal  0.015863 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  47.72 
 
 		 249 aa  238  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  47.08 
 
 		 254 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  45.15 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  45.42 
 
 		 243 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  47.68 
 
 		 240 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.69 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  45.42 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  45.83 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  48.52 
 
 		 240 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  44.67 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  45.23 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  46.67 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  46.25 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  44.63 
 
 		 245 aa  235  4e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  46.41 
 
 		 250 aa  235  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  51.05 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  47.26 
 
 		 240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 241 aa  235  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  44.73 
 
 		 241 aa  235  6e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  45 
 
 		 252 aa  235  6e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  45.23 
 
 		 244 aa  235  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  47.08 
 
 		 243 aa  235  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  45.61 
 
 		 244 aa  235  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12291  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  44.35 
 
 		 246 aa  234  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.782206  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  43.75 
 
 		 248 aa  234  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14761  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  45.68 
 
 		 248 aa  234  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0558262 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1547  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.06 
 
 		 241 aa  234  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.08 
 
 		 255 aa  234  8e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.68 
 
 		 240 aa  234  8e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  49.17 
 
 		 247 aa  234  9e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  47.5 
 
 		 240 aa  234  9e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  45 
 
 		 247 aa  234  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  46.41 
 
 		 242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.1 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  45.15 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  46.84 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  47.5 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  48.1 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  48.1 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  48.1 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  46.84 
 
 		 264 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  45.83 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6962  ABC transporter related  47.26 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  45.31 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5113  ABC transporter related  48.76 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0263177 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  45.87 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>