More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0289 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0289  general L-amino acid transport ATP-binding protein AapP  100 
 
 
245 aa  504  9.999999999999999e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0663  SMR family multidrug efflux pump  84.08 
 
 
245 aa  433  1e-120  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0692  conserved hypothetical protein, ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family (ATP-binding protein)  72.61 
 
 
245 aa  373  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.611773  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0519  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.12 
 
 
245 aa  368  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1470  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  69.71 
 
 
245 aa  367  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000837617  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0494  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.54 
 
 
245 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000537818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  62.45 
 
 
255 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.63 
 
 
255 aa  334  7e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  62.66 
 
 
265 aa  329  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  61.22 
 
 
256 aa  322  3e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  60.49 
 
 
259 aa  322  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  60.58 
 
 
253 aa  317  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5219  ABC transporter related  61.83 
 
 
257 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3083  glutamine/glutamate ABC transporter, ATP-binding protein  59.75 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262111  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.37 
 
 
252 aa  311  5.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  58.61 
 
 
251 aa  296  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  55.51 
 
 
253 aa  292  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  56.49 
 
 
248 aa  287  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  55.88 
 
 
262 aa  286  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.85 
 
 
252 aa  285  4e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  53.91 
 
 
259 aa  285  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.43 
 
 
252 aa  284  8e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  54.39 
 
 
253 aa  284  9e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  53.97 
 
 
253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  55.65 
 
 
248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 
251 aa  283  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  54.62 
 
 
249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  54.2 
 
 
249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  55.27 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0121  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.47 
 
 
246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  54.58 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.01 
 
 
252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  54.01 
 
 
252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  54.01 
 
 
252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  57.08 
 
 
242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  54.01 
 
 
252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.01 
 
 
252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  54.01 
 
 
252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.01 
 
 
252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  52.08 
 
 
253 aa  281  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  53.33 
 
 
252 aa  281  7.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  53.11 
 
 
265 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 
254 aa  281  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  53.97 
 
 
254 aa  281  9e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  53.97 
 
 
254 aa  281  9e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  53.75 
 
 
254 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  54.81 
 
 
258 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  54.85 
 
 
248 aa  279  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  53.97 
 
 
249 aa  279  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  53.56 
 
 
262 aa  278  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  53.56 
 
 
258 aa  278  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  53.33 
 
 
263 aa  278  7e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  52.5 
 
 
254 aa  277  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  50.83 
 
 
253 aa  277  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  54.81 
 
 
251 aa  277  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  53.33 
 
 
254 aa  277  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  54.17 
 
 
244 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  54.24 
 
 
242 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.08 
 
 
254 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  52.92 
 
 
263 aa  276  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  53.81 
 
 
243 aa  275  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  53.59 
 
 
246 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  52.72 
 
 
259 aa  275  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  52.74 
 
 
253 aa  275  4e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  52.3 
 
 
262 aa  275  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  52.3 
 
 
262 aa  275  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  55.08 
 
 
242 aa  275  6e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  53.16 
 
 
248 aa  274  7e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  54.58 
 
 
249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.9 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  53.85 
 
 
247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  51.9 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  56.54 
 
 
242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.32 
 
 
284 aa  273  3e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.5 
 
 
240 aa  272  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  55.13 
 
 
257 aa  272  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  52.5 
 
 
257 aa  272  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.69 
 
 
260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  52.97 
 
 
268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  53.59 
 
 
251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  51.69 
 
 
260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  51.69 
 
 
260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  52.74 
 
 
247 aa  271  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  51.67 
 
 
257 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.83 
 
 
269 aa  270  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  53.59 
 
 
246 aa  270  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  52.7 
 
 
264 aa  270  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  53.59 
 
 
250 aa  269  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  51.25 
 
 
267 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  51.67 
 
 
249 aa  269  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.74 
 
 
240 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  52.74 
 
 
244 aa  270  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  52.08 
 
 
267 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  51.67 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  52.99 
 
 
273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  55.27 
 
 
242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  51.67 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  51.46 
 
 
257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  50.62 
 
 
267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  51.69 
 
 
260 aa  268  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>