More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0528 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0528  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 		 258 aa  530  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191469  normal  0.015863 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1511  ABC transporter related  68.18 
 
 		 246 aa  342  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  67.22 
 
 		 242 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  66.67 
 
 		 242 aa  334  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1936  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  66.39 
 
 		 245 aa  334  9e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0352158  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1634  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  62.08 
 
 		 251 aa  309  2e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  60.67 
 
 		 243 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  58.92 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  59.75 
 
 		 242 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  59.75 
 
 		 244 aa  299  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  58.51 
 
 		 243 aa  299  2e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 		 257 aa  299  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  57.85 
 
 		 246 aa  298  6e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  59.5 
 
 		 243 aa  297  9e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  56.43 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0718  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000110627  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  59.5 
 
 		 243 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  59.09 
 
 		 243 aa  295  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  57.68 
 
 		 243 aa  295  6e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  57.92 
 
 		 242 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  56.43 
 
 		 242 aa  294  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  56.49 
 
 		 263 aa  293  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  58.09 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  56.33 
 
 		 247 aa  291  5e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  56.25 
 
 		 249 aa  291  5e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  57.5 
 
 		 246 aa  291  6e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  58.33 
 
 		 239 aa  291  8e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  56.02 
 
 		 252 aa  291  9e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  56.02 
 
 		 252 aa  291  9e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  56.02 
 
 		 252 aa  291  9e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  55.65 
 
 		 262 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  56.02 
 
 		 252 aa  291  9e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  55.65 
 
 		 262 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 		 252 aa  291  9e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  57.44 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  56.07 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  57.2 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  56.61 
 
 		 258 aa  290  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1165  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  59.75 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.19439  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  55.19 
 
 		 251 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.85 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  57.92 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  56.07 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  57.32 
 
 		 249 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  54.76 
 
 		 254 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  57.32 
 
 		 251 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  54.76 
 
 		 254 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  58.75 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  56.67 
 
 		 242 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 		 252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  53.78 
 
 		 257 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  56.68 
 
 		 252 aa  288  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  58.33 
 
 		 240 aa  288  8e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  54.77 
 
 		 242 aa  288  8e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.57 
 
 		 250 aa  288  8e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  55.6 
 
 		 259 aa  288  8e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  54.39 
 
 		 258 aa  287  9e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  54.39 
 
 		 258 aa  287  9e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  53.39 
 
 		 257 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  55.23 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  54.03 
 
 		 256 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  56.18 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  56.8 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  54.12 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.85 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1117  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.67 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000186599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  58.75 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  55.83 
 
 		 247 aa  285  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  52.38 
 
 		 259 aa  285  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  53.33 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.43 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  55.83 
 
 		 246 aa  285  4e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  54.88 
 
 		 262 aa  285  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  58.85 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 		 269 aa  285  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 242 aa  285  4e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  56.61 
 
 		 251 aa  285  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  57.5 
 
 		 246 aa  285  4e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  53.53 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  54.69 
 
 		 247 aa  285  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  58.75 
 
 		 248 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  54.32 
 
 		 256 aa  285  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0929  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  59.34 
 
 		 242 aa  285  7e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.285427  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0892  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  59.34 
 
 		 242 aa  285  7e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.495443  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1000  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  59.34 
 
 		 242 aa  284  8e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  54.77 
 
 		 246 aa  284  8e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  53.75 
 
 		 249 aa  284  8e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  58.47 
 
 		 240 aa  284  9e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  53.94 
 
 		 255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  51.98 
 
 		 253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  56.07 
 
 		 249 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  56.07 
 
 		 249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  56.07 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  52.78 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>