More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1117 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1117  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 		 255 aa  523  1e-147  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000186599  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0718  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  80.65 
 
 		 251 aa  424  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000110627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  64.34 
 
 		 243 aa  315  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  63.52 
 
 		 242 aa  315  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  63.52 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  60.66 
 
 		 242 aa  298  6e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  61.63 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1936  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.66 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0352158  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  59.24 
 
 		 259 aa  295  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  58.09 
 
 		 247 aa  295  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  60 
 
 		 243 aa  295  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  58.78 
 
 		 258 aa  295  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  60.41 
 
 		 243 aa  295  6e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  58.78 
 
 		 251 aa  293  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  57.38 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.55 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  56.97 
 
 		 254 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  56.97 
 
 		 254 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  56.97 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  57.79 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  57.96 
 
 		 249 aa  290  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  55.92 
 
 		 252 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  57.79 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  57.72 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000214  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.97 
 
 		 244 aa  288  7e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  57.38 
 
 		 247 aa  287  9e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  57.79 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  56.97 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0606  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.34 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0551  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  64.34 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  56.97 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0696  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.34 
 
 		 284 aa  286  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0639  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.34 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533598  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1511  ABC transporter related  57.89 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0528  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.67 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191469  normal  0.015863 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  55.92 
 
 		 248 aa  286  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0768  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.93 
 
 		 243 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0550  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  64.34 
 
 		 243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  55.92 
 
 		 248 aa  285  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.55 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  53.47 
 
 		 253 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  54.73 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  56.15 
 
 		 262 aa  285  5e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  55.33 
 
 		 249 aa  285  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  56.97 
 
 		 251 aa  285  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.32 
 
 		 274 aa  285  7e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  57.38 
 
 		 251 aa  284  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  57.61 
 
 		 244 aa  284  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4663  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.52 
 
 		 242 aa  284  9e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.583474  hitchhiker  2.7569099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  55.51 
 
 		 259 aa  284  9e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0707  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.93 
 
 		 298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  56.61 
 
 		 255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  56.97 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  55.14 
 
 		 250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  57.79 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0552  ABC transporter related  63.11 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  57.44 
 
 		 246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  57.92 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.74 
 
 		 251 aa  281  6.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1634  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.78 
 
 		 251 aa  281  6.000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  54.51 
 
 		 249 aa  281  7.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0675  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.7 
 
 		 242 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05950  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.33 
 
 		 247 aa  281  9e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  55.97 
 
 		 263 aa  281  9e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  55.79 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  56.63 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  55.37 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  53.69 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  56.61 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  55.79 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  55.69 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  56.22 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  56.2 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  55.37 
 
 		 257 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  55.92 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  55.37 
 
 		 254 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  54.51 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  54.1 
 
 		 249 aa  279  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.15 
 
 		 242 aa  278  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0204  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 		 239 aa  279  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.701946  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  54.51 
 
 		 245 aa  278  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.1 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  55.97 
 
 		 258 aa  278  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  56.02 
 
 		 254 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  54.96 
 
 		 265 aa  278  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  56.2 
 
 		 248 aa  278  7e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  55.37 
 
 		 257 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  56.15 
 
 		 270 aa  278  7e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  54.51 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  55.33 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  56.33 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  55.74 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 269 aa  276  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  56.85 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2412  ABC transporter related  56.33 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  54.96 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  53.25 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  55.74 
 
 		 252 aa  275  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  54.55 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.37 
 
 		 246 aa  276  3e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>