More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2412 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2412  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  508  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  64.85 
 
 		 250 aa  335  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  60.58 
 
 		 249 aa  330  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  62.76 
 
 		 251 aa  328  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  60.17 
 
 		 249 aa  327  8e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1702  ABC transporter related  63.05 
 
 		 253 aa  327  8e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.478201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  62.45 
 
 		 273 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  60.32 
 
 		 262 aa  325  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  60.73 
 
 		 262 aa  325  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  60.32 
 
 		 262 aa  325  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.24 
 
 		 251 aa  325  5e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  63.67 
 
 		 259 aa  325  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  59.75 
 
 		 249 aa  323  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 251 aa  322  5e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  64.75 
 
 		 255 aa  321  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  60 
 
 		 256 aa  320  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  59.68 
 
 		 250 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 252 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  62.66 
 
 		 252 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.92 
 
 		 251 aa  319  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  59.67 
 
 		 267 aa  319  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 		 269 aa  318  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  57.66 
 
 		 258 aa  318  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  57.66 
 
 		 258 aa  318  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  60.58 
 
 		 267 aa  318  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 252 aa  318  6e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 252 aa  318  6e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  60.08 
 
 		 257 aa  318  7e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  58.06 
 
 		 257 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  61.98 
 
 		 253 aa  317  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  61.07 
 
 		 273 aa  317  7.999999999999999e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  59.11 
 
 		 263 aa  317  9e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  62.18 
 
 		 252 aa  317  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  58.02 
 
 		 252 aa  316  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  58.02 
 
 		 252 aa  316  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 		 249 aa  316  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  58.7 
 
 		 258 aa  316  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  58.06 
 
 		 257 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  58.02 
 
 		 252 aa  316  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  60 
 
 		 261 aa  316  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.02 
 
 		 252 aa  316  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  58.02 
 
 		 252 aa  316  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.02 
 
 		 252 aa  315  5e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  58.7 
 
 		 263 aa  315  6e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  58.47 
 
 		 248 aa  315  6e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  60.48 
 
 		 247 aa  314  7e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  56.45 
 
 		 269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  58.85 
 
 		 266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4091  ABC transporter related  60.98 
 
 		 247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.231596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  58.02 
 
 		 259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  61 
 
 		 255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  61.51 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  57.68 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  62.13 
 
 		 249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  61.92 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.92 
 
 		 260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  59.41 
 
 		 254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  58.47 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  61.32 
 
 		 254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  58.78 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  59.59 
 
 		 258 aa  311  5.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  59.35 
 
 		 265 aa  311  5.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59 
 
 		 254 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  59 
 
 		 254 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  58.58 
 
 		 254 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  59 
 
 		 254 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  57.26 
 
 		 253 aa  311  6.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  61.09 
 
 		 246 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  60.48 
 
 		 265 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  63.41 
 
 		 251 aa  311  7.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  58.2 
 
 		 253 aa  311  9e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  59.59 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  61.83 
 
 		 242 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  56.85 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  60.08 
 
 		 247 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  58.94 
 
 		 247 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  60.67 
 
 		 246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  59.85 
 
 		 257 aa  309  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  61.09 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  58.16 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  65.53 
 
 		 241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.74 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  59.83 
 
 		 245 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  59.83 
 
 		 246 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  57.09 
 
 		 268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  60.49 
 
 		 242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  59.34 
 
 		 243 aa  306  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  61.92 
 
 		 244 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  58.68 
 
 		 248 aa  306  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  58.47 
 
 		 254 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  58.68 
 
 		 248 aa  304  8.000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  59.51 
 
 		 255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  59.83 
 
 		 252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  62.14 
 
 		 243 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  55.28 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  59.41 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  59.67 
 
 		 248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  59.2 
 
 		 251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  62.4 
 
 		 242 aa  301  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  58 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>