More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1165 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1165  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  100 
 
 		 242 aa  494  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.19439  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1000  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  74.38 
 
 		 242 aa  381  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0929  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  74.38 
 
 		 242 aa  381  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.285427  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0892  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  74.38 
 
 		 242 aa  381  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.495443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  65.02 
 
 		 242 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  63.37 
 
 		 242 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  61 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  61 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  61 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  61 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61 
 
 		 252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61 
 
 		 252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  59.75 
 
 		 254 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 252 aa  310  9e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  61 
 
 		 253 aa  310  9e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  60.33 
 
 		 266 aa  310  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  61.67 
 
 		 273 aa  310  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  60.83 
 
 		 273 aa  310  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  61 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  58.85 
 
 		 259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  60.08 
 
 		 267 aa  308  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  60.58 
 
 		 253 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  59.5 
 
 		 262 aa  307  8e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  59.5 
 
 		 262 aa  307  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  59.34 
 
 		 253 aa  307  9e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  58.51 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  60.58 
 
 		 253 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  60.08 
 
 		 249 aa  306  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  59.5 
 
 		 262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  59.09 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  60.83 
 
 		 257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  59.75 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  60 
 
 		 257 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  57.68 
 
 		 254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.67 
 
 		 251 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  59.67 
 
 		 249 aa  304  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 		 254 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  57.26 
 
 		 254 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  60 
 
 		 256 aa  304  9.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  57.26 
 
 		 254 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  60.42 
 
 		 268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  58.33 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  59.26 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  58.33 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  61.98 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  58.26 
 
 		 263 aa  301  5.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  58.68 
 
 		 257 aa  301  7.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  59.26 
 
 		 243 aa  301  9e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  60.25 
 
 		 259 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  57.85 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  59.58 
 
 		 254 aa  299  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  55.97 
 
 		 252 aa  298  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  57.08 
 
 		 269 aa  298  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  57.2 
 
 		 253 aa  298  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  57.08 
 
 		 258 aa  298  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  57.68 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  56.79 
 
 		 255 aa  295  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  57.2 
 
 		 248 aa  295  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  59.49 
 
 		 249 aa  295  6e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  59.5 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  58.51 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  56.79 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  56.79 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  57.68 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  56.67 
 
 		 267 aa  292  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  59.26 
 
 		 257 aa  292  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  56.38 
 
 		 248 aa  291  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 284 aa  290  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  60.17 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0528  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.75 
 
 		 258 aa  290  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191469  normal  0.015863 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  57.26 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  56.2 
 
 		 246 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 		 251 aa  290  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  55.28 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  56.05 
 
 		 251 aa  289  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  56.85 
 
 		 265 aa  289  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  58.09 
 
 		 244 aa  288  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  58.09 
 
 		 246 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  54.77 
 
 		 260 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  56.61 
 
 		 245 aa  288  5.0000000000000004e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  57.2 
 
 		 242 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  56.25 
 
 		 247 aa  288  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.77 
 
 		 260 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  54.77 
 
 		 260 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  58.33 
 
 		 253 aa  288  7e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  58.02 
 
 		 246 aa  287  9e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.92 
 
 		 240 aa  286  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.5 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  55.79 
 
 		 261 aa  286  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  57.08 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  57.5 
 
 		 239 aa  285  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  56.02 
 
 		 265 aa  285  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  54.13 
 
 		 247 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>