More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0692 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0692  conserved hypothetical protein, ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family (ATP-binding protein)  100 
 
 		 245 aa  502  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.611773  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0494  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  80.41 
 
 		 245 aa  424  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000537818  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0519  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  80 
 
 		 245 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1470  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  78.78 
 
 		 245 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000837617  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0289  general L-amino acid transport ATP-binding protein AapP  72.61 
 
 		 245 aa  373  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0663  SMR family multidrug efflux pump  73.14 
 
 		 245 aa  371  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  65.69 
 
 		 255 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.15 
 
 		 255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  63.9 
 
 		 259 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  62.66 
 
 		 256 aa  316  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  59.67 
 
 		 265 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.07 
 
 		 252 aa  311  7.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  62.81 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5219  ABC transporter related  59.5 
 
 		 257 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  59.5 
 
 		 253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3083  glutamine/glutamate ABC transporter, ATP-binding protein  59.5 
 
 		 253 aa  301  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.96 
 
 		 242 aa  285  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  56.02 
 
 		 242 aa  281  5.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  53.69 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  56.54 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.12 
 
 		 253 aa  278  5e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  55.19 
 
 		 242 aa  278  5e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.7 
 
 		 242 aa  278  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.54 
 
 		 284 aa  277  9e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  53.09 
 
 		 251 aa  277  9e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  52.74 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  53.78 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  52.94 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  52.97 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  54.24 
 
 		 249 aa  275  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  54.01 
 
 		 253 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  54.66 
 
 		 243 aa  275  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  57.2 
 
 		 252 aa  275  4e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  54.01 
 
 		 253 aa  275  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 		 252 aa  274  8e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  54.7 
 
 		 253 aa  274  8e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  54.24 
 
 		 253 aa  274  8e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  53.39 
 
 		 263 aa  274  9e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  54.2 
 
 		 257 aa  274  9e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  53.39 
 
 		 263 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.52 
 
 		 252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  52.52 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  52.52 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.52 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  52.52 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  53.39 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.52 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  55.08 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.52 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  53.42 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  52.52 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  52.52 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  52.72 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  53.36 
 
 		 247 aa  272  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  55.7 
 
 		 242 aa  273  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 		 251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  52.97 
 
 		 262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0121  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.26 
 
 		 246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  52.97 
 
 		 262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  51.27 
 
 		 262 aa  271  5.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  52.97 
 
 		 262 aa  271  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  53.36 
 
 		 254 aa  271  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  52.74 
 
 		 254 aa  271  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  51.44 
 
 		 258 aa  271  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  52.74 
 
 		 254 aa  271  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  52.89 
 
 		 249 aa  270  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  54.85 
 
 		 249 aa  270  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  51.9 
 
 		 242 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  52.74 
 
 		 242 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.52 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  52.52 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  52.52 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  52.52 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  52.97 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.69 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  51.69 
 
 		 269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  53.81 
 
 		 253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  52.54 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  53.42 
 
 		 257 aa  268  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  51.68 
 
 		 254 aa  269  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  50.63 
 
 		 244 aa  269  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  52.54 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  54.11 
 
 		 256 aa  268  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  52.54 
 
 		 258 aa  268  5e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  52.56 
 
 		 247 aa  268  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.69 
 
 		 249 aa  268  8e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.26 
 
 		 254 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.26 
 
 		 257 aa  267  8.999999999999999e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  50.61 
 
 		 248 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  49.37 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  52.74 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  53.81 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  52.32 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  54.01 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  51.05 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  52.1 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.11 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  52.56 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  48.74 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>